基于定量影像組學(xué)特征的非小細(xì)胞肺癌中的EGFR基因突變預(yù)測(cè)
發(fā)布時(shí)間:2020-03-18 12:20
【摘要】:目前,肺癌仍是全球醫(yī)學(xué)技術(shù)攻克的難點(diǎn),有效降低每年高發(fā)的致死率和發(fā)病率同樣是棘手的問(wèn)題。由于肺癌中約85%的患者為非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)類型。因此,非小細(xì)胞肺癌是目前研究的重點(diǎn)和熱點(diǎn)。隨著醫(yī)療水平的不斷提高,非小細(xì)胞肺癌的預(yù)后治療水平已經(jīng)到了基因的層面,表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)基因突變狀態(tài)的檢測(cè)對(duì)非小細(xì)胞肺癌患者個(gè)體化治療和改善預(yù)后都有重要的臨床意義。當(dāng)處于晚期的非小細(xì)胞患者被確切診斷為表皮生長(zhǎng)因子受體突變,采用酪氨酸激酶抑制劑(TKI)來(lái)進(jìn)行治療已成為廣泛接受的方式,F(xiàn)階段比較流行的檢測(cè)病人是否發(fā)生EGFR突變的方式是通過(guò)擴(kuò)增阻滯突變系統(tǒng)(amplification refractory mutation system,ARMS)和直接測(cè)序進(jìn)行特異性靶點(diǎn)檢測(cè)。然而,直接測(cè)序需要對(duì)樣本病變組織進(jìn)行活檢,雖然準(zhǔn)確率很高,考慮到該方法需要進(jìn)行局部手術(shù)穿刺來(lái)獲取腫瘤組織,檢查過(guò)程會(huì)花費(fèi)高額費(fèi)用,且檢查結(jié)果需要較長(zhǎng)時(shí)間。再者,該測(cè)序方法對(duì)所采用的技術(shù)和測(cè)試材料都有高標(biāo)準(zhǔn)的要求。而ARMS檢測(cè)方法采用較新的檢測(cè)技術(shù),同樣無(wú)法普及。此外,當(dāng)癌變發(fā)生后才進(jìn)行檢測(cè),多數(shù)患者在確診后已經(jīng)屬于晚期,不采取一些有效的及時(shí)治療,生存率基本在10%以下。如果病人及時(shí)被發(fā)現(xiàn)EGFR突變,可采取靶向藥物治療,可有效減少其進(jìn)行化療所帶來(lái)的較大的副作用和在一定程度上改善發(fā)病期間生活狀況。針對(duì)上述臨床難題,本文提出利用新興的影像組學(xué)方法對(duì)EGFR突變進(jìn)行了理論和統(tǒng)計(jì)學(xué)的研究。首先本章通過(guò)嚴(yán)格的入組標(biāo)準(zhǔn),篩選出180例病人作為研究對(duì)象。然后對(duì)每個(gè)病人的計(jì)算機(jī)斷層掃描(Computed Tomography,CT)影像中進(jìn)行高標(biāo)準(zhǔn)手動(dòng)分割,將得到的感興趣區(qū)域進(jìn)行統(tǒng)一化處理。接著對(duì)每個(gè)病人提取485個(gè)三維影像組學(xué)特征進(jìn)行量化。為了使研究更有臨床意義,在影像組學(xué)特征的基礎(chǔ)上,該研究收集了5個(gè)和EGFR突變高度相關(guān)的臨床特征進(jìn)行分析,采用套索回歸算法(Least absolute shrinkage and selection operator,Lasso)從提取的485個(gè)高維特征和5個(gè)臨床變量中自動(dòng)地選擇出具有預(yù)測(cè)EGFR突變能力的10個(gè)特征,利用邏輯斯特回歸算法建立模型來(lái)預(yù)測(cè)EGFR突變。為了直觀體現(xiàn)模型的性能,繪制了受試者工作特征曲線(Receiver operating characteristic curve,ROC),其中訓(xùn)練集的受試者工作特征曲線下面積(Area under ROC curve,AUC)為0.8618,驗(yàn)證集的AUC為0.8725,最后繪制了諾模圖(nomogram)來(lái)直觀反映出每個(gè)病人突變的風(fēng)險(xiǎn),從而為診斷非小細(xì)胞肺癌的患者是否有EGFR突變提供了新思路。
【圖文】:
1圖 1-1 2000 年至 2011 年中國(guó)男性的癌癥發(fā)病率.1-1 Trends in incidence rates for selected cancers for males in China, 2000 to 此,,如何降低肺癌的死亡率是一個(gè)亟待解決的挑戰(zhàn)性臨床問(wèn)題。,通過(guò)組織病理分型可將肺癌分為小細(xì)胞肺癌和非小細(xì)胞肺癌(ng cancer, NSCLC)兩類,其中非小細(xì)胞肺癌約占 85%[3]。對(duì)于非小
顯子缺失”是指切除了 EGFR 蛋白中負(fù)責(zé)抑制它自身活性的部分。這兩種突變方式占到肺癌 EGFR 突變的 90%[18];另一種是 EGFR 蛋白的第 858 個(gè)氨基酸從L 突變?yōu)?R,即 L858R 突變[19]。1.2.1 國(guó)內(nèi)外表皮生長(zhǎng)因子(EGFR)突變機(jī)制Blackhall 等人指出, EGFR 作為癌癥預(yù)后改善的主要控制因素[20],它在大多數(shù)非小細(xì)胞肺癌患者中都有表達(dá),例如對(duì)細(xì)胞增殖的作用,抑制細(xì)胞凋亡,血管生成,轉(zhuǎn)移電勢(shì)和化學(xué)抗性的反應(yīng)等(圖 1-2)。如圖所示,EGFR 結(jié)構(gòu)的組成部分包括在細(xì)胞外部的配位體,通過(guò)細(xì)胞膜物質(zhì)交換的區(qū)域,和存在于內(nèi)部的酪氨酸酶作用范圍所構(gòu)成。與該受體結(jié)合的配體如表皮生長(zhǎng)因子和轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子α通過(guò)引起受體酪氨酸激酶的磷酸化和下游細(xì)胞內(nèi)信號(hào)通路的激活來(lái)調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖和生存,例如對(duì)絲裂原活化蛋白激酶和磷脂酰肌醇 3 激酶的磷酸化過(guò)程可以說(shuō)明。
【學(xué)位授予單位】:哈爾濱理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R734.2;TP391.41
本文編號(hào):2588707
【圖文】:
1圖 1-1 2000 年至 2011 年中國(guó)男性的癌癥發(fā)病率.1-1 Trends in incidence rates for selected cancers for males in China, 2000 to 此,,如何降低肺癌的死亡率是一個(gè)亟待解決的挑戰(zhàn)性臨床問(wèn)題。,通過(guò)組織病理分型可將肺癌分為小細(xì)胞肺癌和非小細(xì)胞肺癌(ng cancer, NSCLC)兩類,其中非小細(xì)胞肺癌約占 85%[3]。對(duì)于非小
顯子缺失”是指切除了 EGFR 蛋白中負(fù)責(zé)抑制它自身活性的部分。這兩種突變方式占到肺癌 EGFR 突變的 90%[18];另一種是 EGFR 蛋白的第 858 個(gè)氨基酸從L 突變?yōu)?R,即 L858R 突變[19]。1.2.1 國(guó)內(nèi)外表皮生長(zhǎng)因子(EGFR)突變機(jī)制Blackhall 等人指出, EGFR 作為癌癥預(yù)后改善的主要控制因素[20],它在大多數(shù)非小細(xì)胞肺癌患者中都有表達(dá),例如對(duì)細(xì)胞增殖的作用,抑制細(xì)胞凋亡,血管生成,轉(zhuǎn)移電勢(shì)和化學(xué)抗性的反應(yīng)等(圖 1-2)。如圖所示,EGFR 結(jié)構(gòu)的組成部分包括在細(xì)胞外部的配位體,通過(guò)細(xì)胞膜物質(zhì)交換的區(qū)域,和存在于內(nèi)部的酪氨酸酶作用范圍所構(gòu)成。與該受體結(jié)合的配體如表皮生長(zhǎng)因子和轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子α通過(guò)引起受體酪氨酸激酶的磷酸化和下游細(xì)胞內(nèi)信號(hào)通路的激活來(lái)調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖和生存,例如對(duì)絲裂原活化蛋白激酶和磷脂酰肌醇 3 激酶的磷酸化過(guò)程可以說(shuō)明。
【學(xué)位授予單位】:哈爾濱理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R734.2;TP391.41
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條
1 張利文;方夢(mèng)捷;臧亞麗;朱永北;董迪;劉俠;田捷;;影像組學(xué)的發(fā)展與應(yīng)用[J];中華放射學(xué)雜志;2017年01期
2 容毓;羅凱;薛興陽(yáng);賀智敏;;DNA直接測(cè)序技術(shù)檢測(cè)EGFR基因及突變分析[J];廣州醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2013年02期
3 任睿欣;李嘉瑜;李雪飛;陳秀;任勝祥;周彩存;;擴(kuò)增阻滯突變系統(tǒng)法檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌微小標(biāo)本表皮生長(zhǎng)因子受體突變[J];腫瘤;2012年11期
本文編號(hào):2588707
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