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油菜細胞核雄性不育系9012A不育基因BnRf~b的克隆與功能分析

發(fā)布時間:2020-02-01 17:01
【摘要】:油菜是全世界主要農(nóng)作物之一,是食用植物油和飼用蛋白質(zhì)的重要來源,其工業(yè)用途也十分廣泛。雜種優(yōu)勢利用對油菜產(chǎn)量的提高起到了重要推動作用,在雜種優(yōu)勢利用途徑中雄性不育的利用是主要途徑之一,細胞核雄性不育系9012A及其衍生系已經(jīng)被廣泛應用于油菜雜交種商業(yè)化制種,其雄性不育性狀由Bn Ms3和Bn Rf兩個位點控制。為解析9012A雄性不育及其育性恢復的分子機理,恢復基因Bn Ms3已經(jīng)被成功克隆,其編碼的蛋白與葉綠體內(nèi)膜轉(zhuǎn)運蛋白Tic40同源;前人對Bn Rf位點已經(jīng)精細定位,并通過BAC測序得到了臨保系中等位基因Bn Rf c的候選區(qū)間。本研究在前人研究的基礎上,進一步發(fā)現(xiàn)不育系和恢復系中Bn Rf候選區(qū)間序列與臨保系參考序列差異很大。為獲得不育系和恢復系中Bn Rf候選區(qū)間真實序列,構(gòu)建了包含Bn Rf位點不育基因BnRf~b和恢復基因Bn Rf a的BAC克隆文庫,通過測序分別得到了包含BnRf~b和Bn Rf a的候選區(qū)間序列,揭示了不育系和恢復系材料在Bn Rf位點復雜的染色體結(jié)構(gòu)變異。同時,通過分析RG206AB和RG250AB兩個不同遺傳背景的定位群體,本研究對Bn Rf位點育性控制基因進行了進一步精細定位,并完成了不育基因的克隆與功能驗證。主要研究結(jié)果如下:1、本研究構(gòu)建了一個甘藍型油菜基因組BAC文庫,篩選得到了分別包含Bn Rf a和BnRf~b的BAC單克隆。序列分析發(fā)現(xiàn),相對于臨保系,不育系和恢復系在Bn Rf位點存在一個大片段插入以及一個局部序列的倒位,Bn Rf基因在恢復系的定位區(qū)間實際為58.1 Kb,在不育系中相對應的區(qū)間為63.1 Kb。2、根據(jù)不育系和恢復系中Bn Rf候選區(qū)間的序列差異,新開發(fā)了8個分子標記,通過分析RG206AB和RG250AB兩個定位群體,最終將Bn Rf a限定到35.9 Kb的物理區(qū)間內(nèi),預測包含7個開放閱讀框(ORF)。3、候選基因G14在不育系和恢復系中的等位基因,在啟動子區(qū)域存在兩個插入缺失變異,最有可能是目標基因。本研究通過農(nóng)桿菌介導將包含不育系來源G14全長的基因組片段AGS14-1轉(zhuǎn)化到遺傳背景為Bnms3的野生型擬南芥中,獲得了27株轉(zhuǎn)基因陽性單株。表型調(diào)查發(fā)現(xiàn)27個陽性單株都表現(xiàn)為花絲短小,花藥皺縮,沒有可育花粉,其雄性不育表型與RG206A十分相似;T1代陽性單株與野生型雜交,在T2代分離群體中,雄性不育表型與AGS14-1轉(zhuǎn)基因片段共分離。進一步的細胞學觀察表明,不育擬南芥與RG206A花藥的異常發(fā)育過程也基本相同。不僅如此,外源導入Bn Ms3還能夠徹底恢復AGS14-1導致的擬南芥雄性不育,這與甘藍型油菜中Bn Ms3能夠特異性恢復9012A類型不育系的育性相一致。因此,可以確認基因組片段AGS14-1包含導致RG206A產(chǎn)生雄性不育的BnRf~b基因。4、將恢復系中與AGS14-1等位的基因組片段AGS14-2導入擬南芥野生型,轉(zhuǎn)基因陽性單株也均表現(xiàn)為雄性不育,因此恢復系來源的基因組片段AGS14-2可能也包含雄性不育基因BnRf~b。因而推測,Bn Rf位點恢復基因Bn Rf a與不育基因BnRf~b可能并不等位,恢復基因可能對應于35.9 Kb候選區(qū)段內(nèi)的另一個基因。5、AGS14-1和AGS14-2片段上都包含預測的開放閱讀框G14,其蛋白編碼序列完全相同。通過PCR從RG206H花藥c DNA文庫中擴增獲得的G14全長CDS包含9個外顯子,編碼一個1386個氨基酸的蛋白。DNA水平和蛋白水平的同源性分析表明G14是一個嵌合基因,由3段與不同基因同源的序列組成。由于G14中較大一段序列與mt HSP70-1高度同源,因此我們將G14命名為Bna A7.mt HSP70-1-like。在可育材料RG206H中,Bna A7.mt HSP70-1-like在花藥發(fā)育的整個過程中持續(xù)表達,在減數(shù)分裂時期其表達水平較高;而在不育材料RG206A中,Bna A7.mt HSP70-1-like僅在花藥發(fā)育的減數(shù)分裂時期有微弱表達。6、油菜核不育基因Bna A7.mt HSP70-1-like在擬南芥中異位表達,對絨氈層分化相關基因沒有明顯影響,但卻明顯抑制了絨氈層退化相關基因的表達。與此相一致,在油菜不育系RG206A中我們觀察到絨氈層細胞的PCD明顯延遲。7、在公用數(shù)據(jù)庫中的序列比對分析,僅在甘藍參考基因組上找到一個Bna A7.mt HSP70-1-like基因的同源基因,擬南芥及其他物種中均沒有該嵌合基因的同源基因。甘藍型油菜和白菜參考基因組上也不存在Bna A7.mt HSP70-1-like或其同源基因,但本研究對190份甘藍型油菜及24份白菜材料進行分析,其中有52份甘藍型油菜及20份白菜材料包含Bna A7.mt HSP70-1-like基因。
【圖文】:

序列,制種模式,細胞核雄性不育,三系


圖 1.19012A 類型細胞核雄性不育系三系化制種模式(Dong et al., 2012)Fig.1.1 Schematic diagram of three-line breeding process for the recessive nuclear male sterility(Dong et al., 2012)1.1.2 9012A 不育系雄性不育相關基因的定位柯麗萍等以9012AB為研究材料,應用BSA法構(gòu)建了可育基因池和不育基因池,篩選得到了 7 個與 Bnms3 基因緊密連鎖的分子標記,通過對 1506 個單株的近等基因系群體分析,將目標基因定位在 0.5 cM 的遺傳距離內(nèi),,實現(xiàn)了對 Bnms3 基因的精細定位(柯麗萍,2005;Ke et al., 2005)。何俊平等通過緊密連鎖分子標記的序列比對分析,在擬南芥第五染色體上找到了 Bnms3 定位區(qū)間的同源區(qū)段,結(jié)合油菜、甘藍和白菜的ESTs、GSSs序列,開發(fā)出了6個與 Bnms3 基因緊密連鎖的ACGM 標記,最終將目標基因的定位區(qū)間進一步縮小到了 0.034cM 的遺傳距離內(nèi)(He et al., 2008Huang 等則以近等基因系群體 7-7365AB 為材料,將 Bnms3 基因定位在甘藍型油菜N19 連鎖群(Huang et al., 2007)。Dun 等根據(jù)甘藍型油菜定位區(qū)間與擬南芥序列的

葉綠體蛋白,修正模型


圖 1.2 葉綠體蛋白轉(zhuǎn)運的修正模型Fig.1.2 Model for the protein import in chloroplast(Nakai, 2015)1.2.3 Tic40 可能與質(zhì)體內(nèi)脂類合成相關高等植物中飽和脂肪酸的合成在葉綠體基質(zhì)中進行,葉綠體內(nèi)膜在脂類合成中也發(fā)揮著重要作用。絨氈層中特化的質(zhì)體結(jié)構(gòu)——造油體,富含由單半乳糖甘油二脂、甘油三酯、甾醇酯等脂類組成的油滴,在小孢子發(fā)育后期絨氈層細胞裂解后,為花粉外壁合成提供必不可少的脂類物質(zhì)。在修正的葉綠體內(nèi)膜蛋白轉(zhuǎn)運模型中,Tic40 并未參與內(nèi)膜蛋白轉(zhuǎn)運子的組成,因此 Tic40 的真實功能值得重新考慮。也許 Tic40 確實是作為葉綠體基質(zhì)中分子伴侶蛋白結(jié)合在內(nèi)膜上的支架,在蛋白跨膜過程的晚期參與到葉綠體內(nèi)膜蛋白轉(zhuǎn)運(Land Chiu, 2010)。但也有可能,Tic40 并不直接參與葉綠體內(nèi)膜蛋白轉(zhuǎn)運過程,而是在質(zhì)體形成的其它環(huán)節(jié)發(fā)揮重要功能從而間接影響葉綠體的蛋白轉(zhuǎn)運能力。
【學位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S565.4

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