子宮肌瘤差異表達microRNAs的定量分析及靶基因鑒定
發(fā)布時間:2020-02-01 11:14
【摘要】:研究背景:子宮肌瘤(human uterine leiomyomas)是多發(fā)生于生育期婦女的一種對雌孕激素敏感的良性腫瘤,除了可引起月經(jīng)紊亂、經(jīng)量過多等癥狀,更是引起子宮全切術(shù)的常見病因。已知遺傳因素、性激素、生長因子等在子宮肌瘤的形成與生長中起重要作用,但到目前為止,子宮肌瘤確切的發(fā)病機制尚未完全明確,治療上以手術(shù)治療為主,保守治療效果欠佳,因此探索其發(fā)病的分子及細胞機制將有利于疾病的保守治療。最新的研究發(fā)現(xiàn),非編碼小RNA(micro RNA,miRNA)在子宮肌瘤發(fā)生中起著非常重要的調(diào)控作用。2012年,Boryana等通過高通量測序的方法發(fā)現(xiàn),超過50種miRNAs在子宮肌瘤中表達異常,但是迄今為止其中多種miRNAs表達的定量改變及相應(yīng)靶基因的鑒定的報道比較少。因此特設(shè)計本課題,結(jié)合目前研究現(xiàn)狀,我們從高通量分析中確定有表達異常但未見相關(guān)定量分析研究的miRNAs中,隨機選定miR-135b、miR-217、miR-363、miR-451、miR-490、miR-590等6種miRNAs作為研究對象,對這些miRNAs進行差異表達的定量分析及靶基因鑒定,爭取為子宮肌瘤的保守治療提供基于miRNA方向的新靶點。方法:在本次實驗中,我們首先使用ABI公司的micro RNA定量試劑盒進行6種miRNA的熒光定量分析,再通過miRNA靶基因預(yù)測的網(wǎng)站Target Scan對定量分析有變化的miRNA的前三位靶基因進行預(yù)測,并采用RT-PCR方法進行靶基因的定量分析。最后對有定量變化的靶基因運用熒光霉素報告基因?qū)嶒炏到y(tǒng)驗證靶基因的真實性。結(jié)果:(1)和瘤旁組織相比,肌瘤組織中miR-363上調(diào)5.2倍、miR-490上調(diào)6.2倍、miR-135b上調(diào)4.9倍,miR-217下降19%、miR-590下降23%、miR-451下降33%。(2)和瘤旁組織相比,肌瘤組織中miR-363有兩個靶基因(FNIP1和SLC12A5)表達水平顯著降低,miR-135b有一個靶基因(NR3C2)表達水平顯著降低,miR-590有兩個靶基因(ZNF367和YOD1)的表達水平顯著升高;其余13個候選靶基因表達未觀察到明顯變化。(3)上述五種表達變化的靶基因,經(jīng)熒光霉素報告系統(tǒng)驗證,最終證實PNIP1、NR3C2、ZNF367分別為miR-363、miR-135b、miR-590的靶基因,可能在肌瘤發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮作用。結(jié)論:綜上所述,本實驗中6種miRNAs均觀察到差異表達的定量改變,但進一步靶基因鑒定最終僅確定了PNIP1、NR3C2、ZNF367分別為miR-363、miR-135b、miR-590的靶基因,相關(guān)性分析顯示這三個靶基因表達均與相應(yīng)的miRNA呈顯著的負相關(guān),符合miRNA是通過抑制靶基因起作用的這一規(guī)律。以上提示我們盡管多種miRNA表達可發(fā)生變化,但可能不是每種miRNA對子宮肌瘤的發(fā)生發(fā)展均可發(fā)揮作用,通過實驗確定子宮肌瘤中的miRNA及其靶基因,可以為子宮肌瘤的發(fā)病機制及治療研究提供分子機制方面的依據(jù),有助于研究子宮肌瘤的保守靶向治療,降低手術(shù)率。
【圖文】:
第一部分 六種 miRNAs 在子宮肌瘤組織中的差異表達miRNA 廣泛參與了血管生成、細胞增殖等各種生理病理過程,目前國內(nèi)外在子宮肌瘤、子宮內(nèi)膜癌和宮頸癌與 miRNA 關(guān)系方面有大量研究,均發(fā)現(xiàn) miRNA 在這些疾病的發(fā)生發(fā)展中有重要作用。在子宮肌瘤的樣品中,也不乏有通過芯片分析miRNA 的表達變化的,但是對其精細定量的 miRNA 仍然較少。本研究對于芯片分析結(jié)果中的表達變化比較明顯的部分候選 miRNA 進行了精確的 QPCR 定量分析。對其中上調(diào)的三個 miRNA,即 miR-363、miR-490、miR-135b 分析發(fā)現(xiàn),,和瘤旁組織相比,miR-363、miR-490、miR-135b 等的表達在肌瘤組織中有著顯著的表達上調(diào),上調(diào)倍數(shù)分別為 5.2 倍,6.2 倍以及 4.9 倍(圖 1A)。另外,我們同時也檢測了三個主要下降的miRNA,即miR-217、miR-590、miR-451,結(jié)果顯示它們則有著顯著的下調(diào),分別降低至瘤旁組織的 19%,23%以及 33%(圖 1B)。
Targetscan軟件對miR-490靶基因進行預(yù)測的結(jié)果
【學(xué)位授予單位】:第二軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R737.33
本文編號:2575375
【圖文】:
第一部分 六種 miRNAs 在子宮肌瘤組織中的差異表達miRNA 廣泛參與了血管生成、細胞增殖等各種生理病理過程,目前國內(nèi)外在子宮肌瘤、子宮內(nèi)膜癌和宮頸癌與 miRNA 關(guān)系方面有大量研究,均發(fā)現(xiàn) miRNA 在這些疾病的發(fā)生發(fā)展中有重要作用。在子宮肌瘤的樣品中,也不乏有通過芯片分析miRNA 的表達變化的,但是對其精細定量的 miRNA 仍然較少。本研究對于芯片分析結(jié)果中的表達變化比較明顯的部分候選 miRNA 進行了精確的 QPCR 定量分析。對其中上調(diào)的三個 miRNA,即 miR-363、miR-490、miR-135b 分析發(fā)現(xiàn),,和瘤旁組織相比,miR-363、miR-490、miR-135b 等的表達在肌瘤組織中有著顯著的表達上調(diào),上調(diào)倍數(shù)分別為 5.2 倍,6.2 倍以及 4.9 倍(圖 1A)。另外,我們同時也檢測了三個主要下降的miRNA,即miR-217、miR-590、miR-451,結(jié)果顯示它們則有著顯著的下調(diào),分別降低至瘤旁組織的 19%,23%以及 33%(圖 1B)。
Targetscan軟件對miR-490靶基因進行預(yù)測的結(jié)果
【學(xué)位授予單位】:第二軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R737.33
【參考文獻】
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1 陳慶云;張小燕;;子宮肌瘤發(fā)病機制研究進展[J];中國實用婦科與產(chǎn)科雜志;2012年12期
本文編號:2575375
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