基于p23基因的野生柑橘和栽培柑橘上衰退病毒分離株間的遺傳特征分析
發(fā)布時(shí)間:2020-02-01 05:05
【摘要】:【目的】比較分析野生柑橘與栽培柑橘上衰退病毒(CTV)分離株間的分子遺傳特征,為深入解析CTV的遺傳進(jìn)化提供相關(guān)依據(jù)!痉椒ā窟\(yùn)用RT-PCR對(duì)我國(guó)云南、廣西、四川、湖南、江西等省(區(qū))的11個(gè)野生柑橘上的CTV分離株和4個(gè)國(guó)內(nèi)栽培甜橙及柚上的CTV強(qiáng)弱毒代表株分離株的p23基因進(jìn)行擴(kuò)增、測(cè)序,所獲序列與Gen Bank收錄的具有代表性的國(guó)外CTV分離株的相應(yīng)基因序列進(jìn)行比對(duì)分析!窘Y(jié)果】野生柑橘與國(guó)內(nèi)外栽培柑橘上CTV分離株的p23基因序列相似率為87.7%~99.3%;密碼子中堿基含量GC%AT%,密碼子轉(zhuǎn)換數(shù)多于顛換數(shù),第3位的堿基替換數(shù)最多,其次為第1位,最少是第2位;非同義突變與同義突變的比值(dN/dS)小于1,表明p23基因在進(jìn)化過程中承受著凈化選擇。系統(tǒng)聚類分析表明,來自于野生柑橘上的11個(gè)CTV分離株在構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中分屬不同的簇支,與不同來源地具有較高相似性和較低遺傳距離的栽培柑橘上的CTV分離株構(gòu)成同一組群!窘Y(jié)論】野生柑橘與栽培柑橘上的CTV分離株在堿基含量、密碼子轉(zhuǎn)換和顛換率及非同義突變與同義突變比值(dN/dS)等遺傳特征方面均表現(xiàn)出一致性,系統(tǒng)發(fā)育分析表明,野生柑橘上CTV分離株基于p23基因序列的聚類關(guān)系與其地理來源之間無明顯相關(guān)性。
本文編號(hào):2575290
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