【摘要】：采用RT-PCR結(jié)合RACE法從福州野生蕉試管苗中克隆隱花色素和光敏色素基因家族成員的c DNA序列,命名為Mu Cry1、Mu Cry2a、Mu Cry2b、Mu Phy B、Mu Phy C1。Mu Crys和Mu Phys的c DNA序列依次為2 330、2 859、2 752、3 272、3 912 bp,編碼698、666、669、1 089、1 003個氨基酸。生物信息學(xué)分析表明:Mu Crys和Mu Phys均屬不穩(wěn)定、親水蛋白,具跨膜結(jié)構(gòu)域和卷曲螺旋結(jié)構(gòu),都不具信號肽,均定位于細(xì)胞核。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明:Cry1和Cry2聚為兩大類,其中Mu Cry1與小果野蕉、海棗和油棕Cry1的親緣關(guān)系最近,與雙子葉植物大豆Cry1的親緣關(guān)系最遠(yuǎn);Mu Cry2a和Mu Cry2b與小果野蕉、水稻和小麥Cry2的親緣關(guān)系最近,與雙子葉植物碧桃Cry2的親緣關(guān)系最遠(yuǎn);Mu Phy B與小果野蕉Phy B的親緣關(guān)系最近,與雙子葉植物毛果楊Phy B的親緣關(guān)系最遠(yuǎn);Mu Phy C1與小果野蕉和馬來蘭花蕉Phy C的親緣關(guān)系最近,與雙子葉甜橙Phy C親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。q RT-PCR結(jié)果表明:Mu Cry的3個成員和Mu Phy C1對不同光質(zhì)響應(yīng)存在差異,藍(lán)光都可促進(jìn)Mu Cry 3個成員m RNA的轉(zhuǎn)錄,紅光促進(jìn)Mu Phy C1 m RNA的轉(zhuǎn)錄,在黑暗、紅光、綠光和黃光下Mu Cry1的表達(dá)受到抑制;黃光和紅光對Mu Cry2a的轉(zhuǎn)錄水平影響不明顯,而黑暗、暖白光和綠光可抑制Mu Cry2a的表達(dá)水平;Mu Cry2b的轉(zhuǎn)錄水平受藍(lán)光和紅光的正調(diào)控,而受綠光的負(fù)調(diào)控;Mu Phy C1在紅光處理下的表達(dá)量最高,藍(lán)光和暖白光下的表達(dá)量相近,白光、綠光、黃光和黑暗處理下的表達(dá)量差異不大,表明Mu Phy C1積極響應(yīng)紅光刺激。
【圖文】：

第11期MuCry1與油棕（Elaeisguineensis，XP_010939647.1）Cry1基因的同源性高達(dá)81％，MuCry2a與海棗（Phoenixdactylifera，XP_008790851.1）Cry2a的同源性達(dá)75％，MuCry2b與菠蘿（Ananascomosus，OAY67638.1）Cry2b基因的同源性高達(dá)74％，MuPhyB與海棗（Phoenixdactylifera，XP_008790851.1）PhyB的同源性高達(dá)77％，，MuPhyC1與毛果楊（Populustremula，XP_002318913.1）PhyC的同源性達(dá)75％。為了進(jìn)一步研究MuCrys和MuPhys各基因的保守性，經(jīng)NCBIblastp預(yù)測，MuCrys都含有保守結(jié)構(gòu)域crypt_chrom_pln，MuCrys的N端含有與DNA光裂合酶相關(guān)（photolyase-related，PHR）的保守結(jié)構(gòu)域，中間為FAD綁定功能域，且MuCry1C端具Cryptochrome-C超家族。NCBIblastn預(yù)測表明MuPhyB11252503755006257508751000108PAS光感應(yīng)區(qū)GAF結(jié)構(gòu)域光敏色素結(jié)構(gòu)域（PHY）光敏色素保守結(jié)構(gòu)域（122~487aa）。Photosensitivepigmentconservativedomain(122-487aa).圖2MuPhys保守結(jié)構(gòu)域Fig.2ConserveddomainofMuPhysMuPhyC111252503755006257508751003PAS光感應(yīng)區(qū)GAF結(jié)構(gòu)域光敏色素結(jié)構(gòu)域（PHY）光敏色素保守結(jié)構(gòu)域（122-487aa）。Photosensitivepigmentconservativedomain(122-487aa).圖3利用SWISS-MODEL預(yù)測MuCrys和MuPhys的三級結(jié)構(gòu)Fig.3Predictedthe3DstructureofMuCrysandMuPhyswithSWISS-MODELMuCry1MuCry2aMuCry2bMuPhyBMuPhyC1劉轉(zhuǎn)霞等：福州野生蕉隱花色素和光敏色素基因家族的克隆及其表達(dá)分析-2095-

第11期MuCry1與油棕（Elaeisguineensis，XP_010939647.1）Cry1基因的同源性高達(dá)81％，MuCry2a與海棗（Phoenixdactylifera，XP_008790851.1）Cry2a的同源性達(dá)75％，MuCry2b與菠蘿（Ananascomosus，OAY67638.1）Cry2b基因的同源性高達(dá)74％，MuPhyB與海棗（Phoenixdactylifera，XP_008790851.1）PhyB的同源性高達(dá)77％，MuPhyC1與毛果楊（Populustremula，XP_002318913.1）PhyC的同源性達(dá)75％。為了進(jìn)一步研究MuCrys和MuPhys各基因的保守性，經(jīng)NCBIblastp預(yù)測，MuCrys都含有保守結(jié)構(gòu)域crypt_chrom_pln，MuCrys的N端含有與DNA光裂合酶相關(guān)（photolyase-related，PHR）的保守結(jié)構(gòu)域，中間為FAD綁定功能域，且MuCry1C端具Cryptochrome-C超家族。NCBIblastn預(yù)測表明MuPhyB11252503755006257508751000108PAS光感應(yīng)區(qū)GAF結(jié)構(gòu)域光敏色素結(jié)構(gòu)域（PHY）光敏色素保守結(jié)構(gòu)域（122~487aa）。Photosensitivepigmentconservativedomain(122-487aa).圖2MuPhys保守結(jié)構(gòu)域Fig.2ConserveddomainofMuPhysMuPhyC111252503755006257508751003PAS光感應(yīng)區(qū)GAF結(jié)構(gòu)域光敏色素結(jié)構(gòu)域（PHY）光敏色素保守結(jié)構(gòu)域（122-487aa）。Photosensitivepigmentconservativedomain(122-487aa).圖3利用SWISS-MODEL預(yù)測MuCrys和MuPhys的三級結(jié)構(gòu)Fig.3Predictedthe3DstructureofMuCrysandMuPhyswithSWISS-MODELMuCry1MuCry2aMuCry2bMuPhyBMuPhyC1劉轉(zhuǎn)霞等：福州野生蕉隱花色素和光敏色素基因家族的克隆及其表達(dá)分析-2095-

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