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高羊茅FaFT2基因克隆及表達(dá)分析

發(fā)布時間:2019-11-28 23:22
【摘要】:以高羊茅(Festuca arundinacea)‘黔草1號’為材料,利用c DNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)克隆了調(diào)控植物開花關(guān)鍵基因FLOWERING LOCUS T(FT),命名為FaFT2。序列分析結(jié)果表明,FaFT2基因cDNA全長1 073 bp,具有開放閱讀框?yàn)?37bp,編碼一條含178個氨基酸殘基的蛋白質(zhì)。該蛋白序列比對發(fā)現(xiàn),所推測的FaFT2氨基酸序列具有1個保守的磷脂酰乙醇胺結(jié)合蛋白(PEBP)結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)遺傳進(jìn)化樹分析表明FaFT2與黑麥草、節(jié)節(jié)麥和二穗短柄草的FT親緣關(guān)系較近。利用實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)分析高羊茅苗期FaFT2表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)該基因在光照時段表達(dá)水平持續(xù)上調(diào),黑暗時段表達(dá)水平下調(diào)。由此推測,FaFT2基因與高羊茅光周期敏感性具有一定的相關(guān)性,可能在光周期調(diào)控開花途徑中發(fā)揮作用。
【圖文】:

電泳圖,電泳圖,基因,氨基酸序列


與二級結(jié)構(gòu)分析預(yù)測的相同(圖6)。在線軟件SignalP4.1分析的結(jié)果表明該蛋白無信號肽序列。4高羊茅FaFT2氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化通過NCBI中BLAST搜索比對,采用MEGA6.0軟件對FaFT2基因編碼的氨基酸序列和Gen-Bank收錄的19種植物的同源序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,聚類后進(jìn)行分析,結(jié)果表明,高羊茅與黑麥草(AMB21810.1)氨基酸序列一致性為95%,與節(jié)節(jié)麥(XP020173323.1)氨基酸序列一致性為98%,與二穗短柄草(XP010238355.1)氨基酸序列一致性為97%,與高粱(KXG35998.1)和玉米(ONM22839.1)的氨基酸序列一致性均在90%以上,與小野果芭蕉圖1FaFT2基因cDNA擴(kuò)增電泳圖Fig.1ElectropherogramsofcDNAamplificationofFaFT2geneA:3'RACE;B:5'RACE;C:cDNART-PCR。M:DL2000marker。

氨基酸序列,核苷酸序列,氨基酸序列,高羊茅


1526植物生理學(xué)報(bào)(AIU38061.1)、番木瓜(ACX85427.1)及毛白楊(AFU08240.1)序列一致性為80%以上。高羊茅首先與黑麥草、節(jié)節(jié)麥和二穗短柄草聚為一類,然后與玉米和高粱親緣關(guān)系較近(圖7)。5高羊茅FaFT2基因的表達(dá)特征采用實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)分析高羊茅幼苗期葉片中FaFT2基因在48h晝夜的表達(dá)水平,結(jié)果顯示,第一個光周期內(nèi),在光照條件下12:30~20:30,圖2FaFT2基因的核苷酸序列及推導(dǎo)的氨基酸序列Fig.2ThenucleotideanddeducedaminoacidsequencesofFaFT2gene圖3FaFT2保守功能域的預(yù)測分析Fig.3PredictionofconserveddomainsofFaFT2

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本文編號:2567202

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