【摘要】：MADS-box轉(zhuǎn)錄因子是植物生長發(fā)育過程的重要調(diào)控因子。為了解菠蘿MADS-box轉(zhuǎn)錄因子的序列特征和分類情況,本研究采用生物信息學方法,對菠蘿全基因組的MADS-box進行序列分析,包括菠蘿MADS-box轉(zhuǎn)錄因子的數(shù)量、外顯子和內(nèi)含子組成情況、編碼蛋白的基本特性及系統(tǒng)進化樹的分析。結果表明,菠蘿基因組中有40個MADS-box轉(zhuǎn)錄因子,且基因結構分析表明8個菠蘿MADS-box基因符合植物MADS-box基因的典型結構,具有6個內(nèi)含子和7個外顯子;27個菠蘿MADS-box轉(zhuǎn)錄因子編碼氨基酸在200~300個之間,其中最小的Ac MADS40僅有104個氨基酸組成,最大的Ac MADS08由436個氨基酸組成;40個MADS-box蛋白中有31個偏堿性,4個顯酸性,5個呈中性;二級結構分析結果表明,6個MADS-box蛋白無規(guī)卷曲所占比例最高,Ac MADS02α-螺旋和無規(guī)卷曲都為25個,β-轉(zhuǎn)角為5個;其余33個菠蘿MADS-box蛋白均以α-螺旋所占比例最高;亞細胞定位預測結果表明,大多數(shù)MADS-box蛋白定位于細胞核,其他零星分布于其他細胞器;保守基序查找分析表明,包含基序1和基序2的MADS-box蛋白所占比率均在85%以上,說明基序1和基序2是菠蘿MADS-box蛋白中的重要保守基序;系統(tǒng)進化樹分析表明,屬于Ⅰ型的菠蘿MADS-box基因有14個,屬于Ⅱ型的菠蘿MADS-box基因有26個,且可細分為11個亞組,除了FLC和AGL15這兩個亞組中沒有菠蘿MADS-box的成員,其他9個亞組均有菠蘿MADS-box基因的分布。

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 高之楨,陳銳,詹樹萱,孫崇榮,曹凱鳴;水稻中一個與花發(fā)育相關的MADS-box基因的表達檢測[J];復旦學報(自然科學版);2002年01期

2 黃方;遲英俊;喻德躍;;植物MADS-box基因研究進展[J];南京農(nóng)業(yè)大學學報;2012年05期

3 段遠霖,李維明,吳為人,劉華清;植物MADS-box基因的研究進展[J];福建農(nóng)業(yè)大學學報;2003年01期

4 邵堅寅,賈紅武,周瑋斌,朱琪泉,孫崇榮,曹凱鳴;水稻花發(fā)育相關MADS-box基因的克隆[J];復旦學報(自然科學版);1999年05期

5 胡麗芳,金志強,徐碧玉;MADS-box基因在果實發(fā)育、成熟過程中的作用[J];分子植物育種;2005年03期

6 賈紅武,羅達,叢斌,高之楨,邵堅寅,曹凱鳴,孫崇榮;一個新的水稻MADS-box基因的克隆及表達分析[J];植物學報;2000年05期

7 馬輝;張智俊;羅淑萍;;植物MADS-box基因研究進展[J];生物技術通報;2006年06期

8 張君誠;宋育紅;陳夜江;張新文;張杭穎;;MADS-box基因在植物胚珠發(fā)育中的作用[J];種子;2008年05期

9 張則婷;李學寶;;MADS-box基因在植物發(fā)育中的功能[J];植物生理學通訊;2007年02期

10 陳翠翠;馬元武;馮永君;吳存祥;;MADS-box家族蛋白在植物開花、結實及根瘤形成中的多功能調(diào)節(jié)作用[J];華北農(nóng)學報;2008年S2期

相關博士學位論文 前2條

1 趙素珍;MADS-box基因在單子葉植物花發(fā)育中的功能研究[D];中國科學院研究生院（植物研究所）;2005年

2 郭濱;蝴蝶蘭花發(fā)育相關B類MADS-box基因的克隆與鑒定[D];復旦大學;2006年

相關碩士學位論文 前3條

1 王永強;MADS-box基因在水稻和太行花中的相關研究&SAGE在水稻上應用的生物信息學分析[D];中國科學院研究生院（植物研究所）;2005年

2 徐道蘭;問荊（Equisetum arvense）MADS-box基因的克隆與分析[D];上海師范大學;2014年

3 段曉姍;毛茛科C類MADS-Box基因的克隆和表達研究[D];陜西師范大學;2011年

，

本文編號：2564540