蒺藜苜蓿E3泛素連接酶U-box基因克隆及表達分析
【圖文】:
度計檢測,A260/A280值為1.877;A260/A230值為2.054,圖1蒺藜苜蓿RNA提取和MtPUB4基因PCR擴增Fig.1RNAextractionandU-boxE3ubiquitin-ligatingenzymegeneamplicationinM.truncatulaA:RNA提。遥危粒澹簦颍幔悖簦椋铮;B:MtPUB4基因的RT-PCR擴增產物(1~3)AmplificationproductsofMtPUB4genebyRT-PCR(1-3);M:DNAmarker.說明RNA質量較好(圖1A)。將提。遥危练崔D錄合成cDNA第一鏈;以cDNA第一鏈為模板,以基因特異性引物進行PCR擴增目的片段(圖1B),利用DNAMAN拼接后的全長cDNA為2448bp。將該基因命名為MtPUB4,NCBI登錄號為XP_013460388.1。2.2生物信息學分析2.2.1保守結構域運用Expasy網站SMART程序對MtPUB4基因編碼的蛋白結構域分析,結果顯示MtPUB4蛋白215~278位氨基酸具有U-box/AEM家族所具備的典型U-box結構,515~764位氨基酸具有典型的ARM重復結構,,該基因屬于U-box家族的一員,其編碼的U-box保守氨基酸序列為FC-CPLSLELMTDPVIVASGQTYERAFIKNWIDLGLTVCPKTHQTLAHTNLIPNYTVKALIANW。運用NC-BI保守域在線
relistedbelow;Blackindicates100%identity;Pinkindicates75%identity;Blueindicates50%identity.圖3蒺藜苜蓿U-boxE3泛素蛋白MtPUB4進化樹分析Fig.3PhylogenetictreeanalysisofU-boxE3ubiquitin-ligatingenzymeMtPUB4proteinsinM.truncatula菌體在誘導后出現特異性條帶,各個濃度對蛋白表達圖4MtPUB4基因在蒺藜苜蓿不同組織中的相對表達量Fig.4TherelativeexpressionofMtPUB4geneindifferenttissuesofM.truncatula影響不明顯。該蛋白在90kDa條帶處,與預期結果88.36kDa相符(圖6)。說明該蛋白在大腸桿菌中成功誘導,可用于進一步蛋白表達研究。2.6植物表達載體構建將植物表達載體pBI121和克隆載體分別酶切,回收相應片段純化連接、轉化、挑取單菌落、提取質粒,構建MtPUB4基因植物表達載體。經過BamHI酶切鑒定,得到與預期大小一致的目的片段(圖7)。鑒定為陽性的質粒送公司測序后拼接,與基因序列一致,說明成功構建植物表達pBI121-MtPUB4。68ACTAPRATACULTURAESINICA(2016)Vol.25,No.7
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