蒺藜苜蓿E3泛素連接酶U-box基因克隆及表達分析
【圖文】:
度計檢測,A260/A280值為1.877;A260/A230值為2.054,圖1蒺藜苜蓿RNA提取和MtPUB4基因PCR擴增Fig.1RNAextractionandU-boxE3ubiquitin-ligatingenzymegeneamplicationinM.truncatulaA:RNA提。遥危粒澹簦颍幔悖簦椋铮睿唬拢海停簦校眨拢椿虻模遥裕校茫覕U增產(chǎn)物(1~3)AmplificationproductsofMtPUB4genebyRT-PCR(1-3);M:DNAmarker.說明RNA質(zhì)量較好(圖1A)。將提。遥危练崔D(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈;以cDNA第一鏈為模板,以基因特異性引物進行PCR擴增目的片段(圖1B),利用DNAMAN拼接后的全長cDNA為2448bp。將該基因命名為MtPUB4,NCBI登錄號為XP_013460388.1。2.2生物信息學(xué)分析2.2.1保守結(jié)構(gòu)域運用Expasy網(wǎng)站SMART程序?qū)Γ停簦校眨拢椿蚓幋a的蛋白結(jié)構(gòu)域分析,結(jié)果顯示MtPUB4蛋白215~278位氨基酸具有U-box/AEM家族所具備的典型U-box結(jié)構(gòu),515~764位氨基酸具有典型的ARM重復(fù)結(jié)構(gòu),,該基因?qū)儆冢眨猓铮易宓囊粏T,其編碼的U-box保守氨基酸序列為FC-CPLSLELMTDPVIVASGQTYERAFIKNWIDLGLTVCPKTHQTLAHTNLIPNYTVKALIANW。運用NC-BI保守域在線
relistedbelow;Blackindicates100%identity;Pinkindicates75%identity;Blueindicates50%identity.圖3蒺藜苜蓿U-boxE3泛素蛋白MtPUB4進化樹分析Fig.3PhylogenetictreeanalysisofU-boxE3ubiquitin-ligatingenzymeMtPUB4proteinsinM.truncatula菌體在誘導(dǎo)后出現(xiàn)特異性條帶,各個濃度對蛋白表達圖4MtPUB4基因在蒺藜苜蓿不同組織中的相對表達量Fig.4TherelativeexpressionofMtPUB4geneindifferenttissuesofM.truncatula影響不明顯。該蛋白在90kDa條帶處,與預(yù)期結(jié)果88.36kDa相符(圖6)。說明該蛋白在大腸桿菌中成功誘導(dǎo),可用于進一步蛋白表達研究。2.6植物表達載體構(gòu)建將植物表達載體pBI121和克隆載體分別酶切,回收相應(yīng)片段純化連接、轉(zhuǎn)化、挑取單菌落、提取質(zhì)粒,構(gòu)建MtPUB4基因植物表達載體。經(jīng)過BamHI酶切鑒定,得到與預(yù)期大小一致的目的片段(圖7)。鑒定為陽性的質(zhì)粒送公司測序后拼接,與基因序列一致,說明成功構(gòu)建植物表達pBI121-MtPUB4。68ACTAPRATACULTURAESINICA(2016)Vol.25,No.7
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