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蒺藜苜蓿E3泛素連接酶U-box基因克隆及表達分析

發(fā)布時間:2019-11-16 06:45
【摘要】:泛素化在植物生長和發(fā)育過程中起重要作用,E3泛素連接酶負(fù)責(zé)對靶蛋白特異性識別,其中U-box結(jié)構(gòu)的E3泛素連接酶具有調(diào)控植物生長發(fā)育和免疫反應(yīng)等功能,并在抗逆性方面發(fā)揮作用。目前,關(guān)于蒺藜苜蓿U-box家族基因的研究尚未見報道。本研究從蒺藜苜蓿中克隆得到U-box(MtPUB4)基因,該基因cDNA全長2448bp,編碼815個氨基酸,包括1個U-box結(jié)構(gòu)(C-X2-H-X7-C-X7-C-X2-C-H-X2-H)和5個ARM結(jié)構(gòu)域,屬于U-box/ARM類型E3泛素連接酶。構(gòu)建原核表達載體pET-MtPUB4,通過聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)表明在大腸桿菌中表達了MtPUB4蛋白。熒光定量PCR分析表明MtPUB4基因在蒺藜苜;ㄖ械谋磉_量最高,在根中表達量最低。MtPUB4基因受到NaCl、聚乙二醇、脫落酸誘導(dǎo),隨著誘導(dǎo)時間增加,表達量呈現(xiàn)出增長趨勢。這些結(jié)果表明,MtPUB4基因在蒺藜苜蓿生長發(fā)育和抗逆性中可能起到重要調(diào)節(jié)作用,但在低溫脅迫中表達量稍微下降,變化不明顯。本研究成功構(gòu)建了pBI121-MtPUB4植物表達載體,為進一步轉(zhuǎn)化擬南芥突變體Atpub4奠定了基礎(chǔ)。
【圖文】:

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度計檢測,A260/A280值為1.877;A260/A230值為2.054,圖1蒺藜苜蓿RNA提取和MtPUB4基因PCR擴增Fig.1RNAextractionandU-boxE3ubiquitin-ligatingenzymegeneamplicationinM.truncatulaA:RNA提。遥危粒澹簦颍幔悖簦椋铮睿唬拢海停簦校眨拢椿虻模遥裕校茫覕U增產(chǎn)物(1~3)AmplificationproductsofMtPUB4genebyRT-PCR(1-3);M:DNAmarker.說明RNA質(zhì)量較好(圖1A)。將提。遥危练崔D(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈;以cDNA第一鏈為模板,以基因特異性引物進行PCR擴增目的片段(圖1B),利用DNAMAN拼接后的全長cDNA為2448bp。將該基因命名為MtPUB4,NCBI登錄號為XP_013460388.1。2.2生物信息學(xué)分析2.2.1保守結(jié)構(gòu)域運用Expasy網(wǎng)站SMART程序?qū)Γ停簦校眨拢椿蚓幋a的蛋白結(jié)構(gòu)域分析,結(jié)果顯示MtPUB4蛋白215~278位氨基酸具有U-box/AEM家族所具備的典型U-box結(jié)構(gòu),515~764位氨基酸具有典型的ARM重復(fù)結(jié)構(gòu),,該基因?qū)儆冢眨猓铮易宓囊粏T,其編碼的U-box保守氨基酸序列為FC-CPLSLELMTDPVIVASGQTYERAFIKNWIDLGLTVCPKTHQTLAHTNLIPNYTVKALIANW。運用NC-BI保守域在線

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relistedbelow;Blackindicates100%identity;Pinkindicates75%identity;Blueindicates50%identity.圖3蒺藜苜蓿U-boxE3泛素蛋白MtPUB4進化樹分析Fig.3PhylogenetictreeanalysisofU-boxE3ubiquitin-ligatingenzymeMtPUB4proteinsinM.truncatula菌體在誘導(dǎo)后出現(xiàn)特異性條帶,各個濃度對蛋白表達圖4MtPUB4基因在蒺藜苜蓿不同組織中的相對表達量Fig.4TherelativeexpressionofMtPUB4geneindifferenttissuesofM.truncatula影響不明顯。該蛋白在90kDa條帶處,與預(yù)期結(jié)果88.36kDa相符(圖6)。說明該蛋白在大腸桿菌中成功誘導(dǎo),可用于進一步蛋白表達研究。2.6植物表達載體構(gòu)建將植物表達載體pBI121和克隆載體分別酶切,回收相應(yīng)片段純化連接、轉(zhuǎn)化、挑取單菌落、提取質(zhì)粒,構(gòu)建MtPUB4基因植物表達載體。經(jīng)過BamHI酶切鑒定,得到與預(yù)期大小一致的目的片段(圖7)。鑒定為陽性的質(zhì)粒送公司測序后拼接,與基因序列一致,說明成功構(gòu)建植物表達pBI121-MtPUB4。68ACTAPRATACULTURAESINICA(2016)Vol.25,No.7

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