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基于實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析的北柴胡內(nèi)參基因的篩選及驗(yàn)證

發(fā)布時(shí)間:2019-10-29 11:25
【摘要】:目的篩選出在北柴胡不同生長(zhǎng)時(shí)期及不同器官中表達(dá)均穩(wěn)定的內(nèi)參基因并進(jìn)行驗(yàn)證。方法利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR獲得18個(gè)候選內(nèi)參基因所有Ct值,通過3種不同算法(Bestkeeper、Norm Finder、Ge Norm)的軟件對(duì)內(nèi)參基因穩(wěn)定性進(jìn)行分析,采用皮爾森相關(guān)系數(shù)(Pearson correlation coefficient)分析3個(gè)軟件給出的穩(wěn)定性排名結(jié)果。結(jié)果所有候選內(nèi)參基因的Ct值相對(duì)寬泛,ADF1b、ADF5、ADF7、e IF2b和ACT2為最為合適的內(nèi)參基因,而e IF6被認(rèn)為穩(wěn)定性最差的內(nèi)參基因。3個(gè)軟件計(jì)算結(jié)果均呈現(xiàn)顯著性相關(guān)。結(jié)論采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)合3種不同算法進(jìn)行北柴胡內(nèi)參基因的篩選及驗(yàn)證是可行的。在北柴胡柴胡分子遺傳研究中,發(fā)掘到的內(nèi)參基因?qū)δ康幕蜻M(jìn)行均一化處理有助于提高目的基因表達(dá)分析的精確性及可信度。
【作者單位】: 西南科技大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81603223) 四川省“十三五”育種攻關(guān)(2006NYZ0036-4-2) 四川省科技扶貧專項(xiàng)(2016NZYZF0071)
【分類號(hào)】:Q943.2;S567.79

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本文編號(hào):2553508

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