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葡萄白藜蘆醇合酶基因的克隆與生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2019-09-17 03:08
【摘要】:以葡萄總RNA為模板,利用RT-PCR的方法從葡萄中擴(kuò)增獲得一條白藜蘆醇合酶基因完整的c DNA序列,命名為RS。利用生物信息學(xué)軟件對其核酸和蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析,結(jié)果表明,該序列長1179 bp,與已報(bào)道的葡萄白藜蘆醇合酶基因的序列相似性達(dá)到94%~99%,氨基酸序列相似性為96%~99%;RS基因編碼392個氨基酸,氨基酸序列含有完整的芪合酶家族的特征序列GVLFGPGLT和活性中心序列GCYAGGTVLR;預(yù)測的分子量為42.78 k Da,理論等電點(diǎn)為6.57,不穩(wěn)定參數(shù)為35.92,在分類上屬于穩(wěn)定性蛋白;二級結(jié)構(gòu)主要以α-螺旋、無規(guī)則卷曲以及β-折疊為主,其中α-螺旋含量為44.13%、無規(guī)則卷曲含量為26.53%,β-折疊含量為17.66%。
【作者單位】: 山東大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院微生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;重組蛋白基因檢測技術(shù)國家地方聯(lián)合工程實(shí)驗(yàn)室山東博奧克生物科技有限公司;
【分類號】:Q943.2

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