小麥品種東農(nóng)冬麥2號根中TaEXPA7部分同源基因的克隆及表達特性分析
【圖文】:
1兩個保守結(jié)構(gòu)域,其三級結(jié)構(gòu)沒有明顯差異(圖3)。利用DNAMAN進行氨基酸同源比對結(jié)果(圖4)表明,3條序列僅在信號肽處有兩個氨基酸的編碼存在差異。而冬小麥與春小麥中TaEXPA7-A/B/D僅在核苷酸序列中存在堿基差異,蛋白序列不存在差異。眾所周知,一般的蛋白質(zhì)都通過保守的結(jié)構(gòu)域行使其功能,而本試驗中的這3條氨基酸序列僅在信號肽處存在差異,其功能是否相似還有待研究。M為DL2000,1為樣品M:DL2000,1:Sample圖2TaEXPA7-A/B/DCDS的PCR擴增結(jié)果Fig.2PCRamplificationofTaEXPA7-A/B/DCDS圖3TaEXPA7-A/B/D編碼蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測Fig.3PredictionofthetertiarystructureofproteinsencodedbyTaEXPA7-A/B/D2.3TaEXPA7-A/B/D基因的序列比對和系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建在NCBI數(shù)據(jù)庫中進行BLAST檢索,發(fā)現(xiàn)TaEXPA7-A/B/D基因序列與節(jié)節(jié)麥(XP_020162651.1)、二穗短柄草(XP_003580384.1)、水稻(XP_015636818.1)等大多數(shù)單子葉植物的同源性較高,表明TaEXPA7-A/B/D基因普遍存在于單子葉植物中。用ClustalX軟件對這些氨基酸序列進行多序列比對,用MEGA6.0進行系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建(圖5),并用BOXSHADE對這些氨基酸序列進行著色,分析其結(jié)構(gòu)(圖6)。結(jié)果表明
酸的編碼存在差異。而冬小麥與春小麥中TaEXPA7-A/B/D僅在核苷酸序列中存在堿基差異,蛋白序列不存在差異。眾所周知,一般的蛋白質(zhì)都通過保守的結(jié)構(gòu)域行使其功能,而本試驗中的這3條氨基酸序列僅在信號肽處存在差異,其功能是否相似還有待研究。M為DL2000,1為樣品M:DL2000,1:Sample圖2TaEXPA7-A/B/DCDS的PCR擴增結(jié)果Fig.2PCRamplificationofTaEXPA7-A/B/DCDS圖3TaEXPA7-A/B/D編碼蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測Fig.3PredictionofthetertiarystructureofproteinsencodedbyTaEXPA7-A/B/D2.3TaEXPA7-A/B/D基因的序列比對和系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建在NCBI數(shù)據(jù)庫中進行BLAST檢索,發(fā)現(xiàn)TaEXPA7-A/B/D基因序列與節(jié)節(jié)麥(XP_020162651.1)、二穗短柄草(XP_003580384.1)、水稻(XP_015636818.1)等大多數(shù)單子葉植物的同源性較高,表明TaEXPA7-A/B/D基因普遍存在于單子葉植物中。用ClustalX軟件對這些氨基酸序列進行多序列比對,用MEGA6.0進行系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建(圖5),,并用BOXSHADE對這些氨基酸序列進行著色,分析其結(jié)構(gòu)(圖6)。結(jié)果表明,這些基因序列均具有信號肽和兩個保守結(jié)構(gòu)域(DPBB-1和Pollen-allerg-1),小麥與節(jié)節(jié)麥的氨基酸序列相似性最高,親緣關(guān)系最近。
【作者單位】: 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;哈爾濱學(xué)院;
【基金】:國家基礎(chǔ)科學(xué)人才培養(yǎng)基金項目(J1210069) 中俄國際合作項目(2013DFR30270)
【分類號】:S512.1
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本文編號:2535491
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