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釀酒酵母中SSK2基因與其他鎘耐受相關(guān)基因之間的雙基因缺失菌株構(gòu)建

發(fā)布時(shí)間:2019-07-19 06:14
【摘要】:鎘是一種嚴(yán)重的環(huán)境污染物,對人體具有致癌性,能蓄積在生物體內(nèi)影響機(jī)體的生長、發(fā)育和生殖。有絲分裂原蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinase,MAPK)在調(diào)節(jié)細(xì)胞存活、增殖和分化中是重要的信號分子,并能夠被鎘脅迫激活。釀酒酵母中2個(gè)MAPK信號傳導(dǎo)途徑,高滲透壓甘油(High Osmolarity Glycerol,HOG)途徑和細(xì)胞壁完整性(Cell Wall Integrity,CWI)途徑都參與Cd2+脅迫下的細(xì)胞應(yīng)答。為了進(jìn)一步研究這兩條途徑在調(diào)控Cd2+脅迫方面的相互作用,以HOG途徑的蛋白激酶SSK2基因?yàn)槔?通過合成遺傳陣列(Synthetic Genetic Array,SGA)方法,成功構(gòu)建了SSK2基因與其他52個(gè)Cd2+耐受相關(guān)基因之間的雙基因缺失菌株。為大規(guī)模研究Cd2+耐受基因之間在調(diào)控鎘脅迫方面的遺傳學(xué)相互作用奠定了基礎(chǔ),也為釀酒酵母的相關(guān)研究提供了一個(gè)新的遺傳學(xué)手段。
文內(nèi)圖片:2454背景里的靶菌株ssk2::natMX4構(gòu)建Fig.1Generationofthessk2::natMX4mutant
圖片說明: ?個(gè)CWI信號途徑的組分[11]。為了研究HOG和CWI兩個(gè)途徑之間,以及它們和其他Cd2+耐受性相關(guān)基因之間,在調(diào)控Cd2+脅迫方面的遺傳相互作用,需要構(gòu)建HOG和CWI信號途徑組分基因之間以及它們和其他基因之間的雙基因缺失突變株。為了建立這個(gè)大規(guī)模構(gòu)建雙基因缺失突變株的方法,這里僅以SSK2基因?yàn)槔瑪M構(gòu)建SSK2與其他88個(gè)與Cd2+耐受有關(guān)的基因之間的雙基因缺失株。本研究利用SGA方法[14-15]的原理進(jìn)行構(gòu)建。首先獲得Y2454背景下的ssk2::natMX4單基因缺失株作為靶菌株,其基因型驗(yàn)證如圖1B。圖1Y2454背景里的靶菌株ssk2::natMX4構(gòu)建Fig.1Generationofthessk2::natMX4mutantinY2454backgroundA:PCR擴(kuò)增BY4741背景里ssk2::kanMX4敲除盒(第1泳道);CK:BY4741菌株里野生型SSK2基因片段的PCR;B:Y2454背景里ssk2::natMX4基因型驗(yàn)證(第1泳道);CK:Y2454菌株里缺失基因ssk2::kanMX4片段的PCRA:PCRamplificationofthessk2::kanMX4cassettefromtheBY4741background;CK:PCRamplificationoftheSSK2genefromtheBY4741background;B:Genotypeverificationofthessk2::natMX4alleleintheY2454background;CK:PCRam-plificationofthessk2::kanMX4alleleintheY2454background1期熊兵等:釀酒酵母中SSK2基因與其他鎘耐受相關(guān)基因之間的雙基因缺失菌株構(gòu)建53
文內(nèi)圖片:圖288個(gè)SGA缺失株陣列分布
圖片說明: 2.2SGA缺失株陣列的獲得為了提高菌株構(gòu)建效率,將88個(gè)BY4741背景下的基因缺失株依次點(diǎn)接在影印板的a、b、c和d四個(gè)區(qū)域,每個(gè)區(qū)域的菌株及排列順序都相同(圖2)。圖288個(gè)SGA缺失株陣列分布Fig.2Distributionof88SGAgenedeletionmutantsarraya、b、c和d四個(gè)區(qū)域均有96個(gè)點(diǎn)接位置,影印板中裝有YPD+150μg/mLG418固體培養(yǎng)基。30℃培養(yǎng)1dEachoffourdistrictsofa,b,canddhas96spotsforinoc-ulation.TheplatecontainingYPD+150μg/mLG418solidmediumisculturedforonedayat30℃2.3SGA篩選雙基因缺失株SGA原本是用來進(jìn)行高通量合成致死型分析的,在這里被用來篩選雙基因缺失株(圖3)。靶菌株ssk2::natMX4是MATα型的,而帶有kanMX4標(biāo)簽的SGA陣列菌株是MATa型的,它們在YPD培養(yǎng)基上進(jìn)行雜交,產(chǎn)生MATα/a型的雙倍體菌株,同時(shí)帶有kanMX4和natMX4這2個(gè)遺傳標(biāo)簽。雙倍體菌株在產(chǎn)孢培養(yǎng)基上生成四分孢子,孢子有MATa和MATα兩種交配型。MFA1pr-HIS3報(bào)告子只在MATa型的細(xì)胞中才能表達(dá),所以在SD-HIS的培養(yǎng)基上就能夠篩選出MATa型的單倍體孢子。此外,CAN1基因編碼一種高親和性通透酶,刀豆氨酸和精氨酸都是通過這種通透酶進(jìn)入細(xì)胞的。因?yàn)榈抖拱彼崾蔷彼岬念愃莆,對?xì)胞具有毒害作用,所以在缺少精氨酸的SD+刀豆氨酸(L-Canavanine)的培養(yǎng)基中,含有CAN1基因的菌株是致死的,因?yàn)樗鼈償z取了刀豆氨酸,刀豆氨酸會代替精氨酸合成蛋白質(zhì),由于結(jié)構(gòu)的不同導(dǎo)致蛋白功能出現(xiàn)異常,致使細(xì)胞死亡。因此,利用SD-His-Arg+L-Canavanine培養(yǎng)基就能夠篩選出不含有親本的MATa型單倍體孢子。最后利用YPD+G418+NAT培養(yǎng)基篩選出MATa型中的ssk2::natMX4xxx::kanMX4雙基因缺失株(圖4)。圖3合成遺傳陣列(SGA)方法[16]Fig.3Syntheticg
【作者單位】: 江南大學(xué)生物工程學(xué)院糧食發(fā)酵工藝與技術(shù)國家工程實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(81371784) 江南大學(xué)自主研究計(jì)劃重點(diǎn)項(xiàng)目(JUSRP51313B)
【分類號】:Q933

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本文編號:2516118

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