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芍藥內(nèi)外花瓣發(fā)育形成相關(guān)基因片段的生物信息學(xué)及組織表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2019-06-07 11:19
【摘要】:為揭示芍藥內(nèi)外花瓣形成的分子機(jī)制,以托桂型芍藥品種‘紫鳳羽’為材料,利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序篩選調(diào)控芍藥花型發(fā)育的關(guān)鍵基因序列片段,首先通過生物信息學(xué)方法分析基因片段的蛋白結(jié)構(gòu)與功能以及亞細(xì)胞定位,其次利用qPCR檢測(cè)基因在花瓣中表達(dá)情況。結(jié)果顯示,測(cè)序篩選出2個(gè)關(guān)鍵基因——AGAMOUS(AG)和MADSbox protein2(MADS2),蛋白分析表明兩者均為脂溶親水性不穩(wěn)定蛋白,均無剪切信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu),為非分泌蛋白,二級(jí)結(jié)構(gòu)均以α螺旋(Alpha helix)為主,三維結(jié)構(gòu)模型極為相似,并且包含1個(gè)相同的保守功能域—MADS,很少信號(hào)肽分泌途徑上;qPCR檢測(cè)顯示內(nèi)瓣AG與MADS2表達(dá)量均極顯著高于外瓣(P0.01)。芍藥AG和MADS2蛋白結(jié)構(gòu)功能、表達(dá)水平差異均存在一定的相似性,推測(cè)兩者可能在芍藥花瓣形成過程中發(fā)揮相同的生物學(xué)功能。
[Abstract]:In order to reveal the molecular mechanism of petal formation inside and outside Paeonia lactiflora, the key gene fragments regulating anther development of Paeonia lactiflora were screened by transcriptional group sequencing. Firstly, the protein structure, function and subcellular localization of the gene fragment were analyzed by bioinformatics method, and then the expression of the gene in petals was detected by qPCR. The results showed that two key genes, AGAMOUS (AG) and MADSbox protein2 (MADS2), were sequenced and screened. Protein analysis showed that both of them were lipophilic hydrophilic unstable proteins with no shear signal peptide and transmembrane structure, and were non-secretory proteins. The secondary structure is mainly 偽-helix (Alpha helix), the three-dimensional structure model is very similar, and contains the same conservative functional domain-MADS, rarely signal peptide secretion pathway. QPCR showed that the expression of AG and MADS2 in the inner flap was significantly higher than that in the outer flap (P 0.01). The structural function and expression level of AG and MADS2 proteins in Paeonia lactiflora were similar. It was speculated that they might play the same biological function in the formation of Paeonia lactiflora petals.
【作者單位】: 揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;揚(yáng)州大學(xué)園藝與植物保護(hù)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31372097;31400592) 江蘇省高校自然科學(xué)研究重大項(xiàng)目(13KJA210005)
【分類號(hào)】:Q943.2;S682.12

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本文編號(hào):2494752


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