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蓖麻RcSCP基因克隆與生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2019-06-02 03:28
【摘要】:植物的絲氨酸羧肽酶(serine carboxypeptidases,簡稱SCP)是一類屬于α/β水解酶家族的蛋白酶,在許多生化途徑(包括次生代謝產(chǎn)物的生物合成、催化酰基轉(zhuǎn)移、除草劑共軛、種子萌發(fā)相關(guān)蛋白質(zhì)的降解過程)中起著重要作用。絲氨酸羧肽酶基因是植物的一種抗逆基因,在植物生長發(fā)育及抵抗逆境方面發(fā)揮著重要作用。蓖麻作為重要的油料作物,用途廣泛。本研究利用c DNA末端快速克隆(RACE)方法克隆蓖麻Rc SCP基因的3'端、5'端片段,最后設(shè)計全長引物獲得蓖麻Rc SCP全長序列,并對其進行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,絲氨酸羧肽酶蛋白基因的c DNA完整開放閱讀框序列為1 377 bp,推測它可編碼458個氨基酸;蓖麻Rc SCP蛋白含有絲氨酸羧肽酶蛋白家族保守區(qū),預(yù)測它定位于細胞質(zhì)中。
[Abstract]:Plant serine carboxypeptidase (serine carboxypeptidases, (SCP) is a kind of protease belonging to 偽 / 尾 hydrolase family, which is used in many biochemical pathways (including biosynthesis of secondary metabolites, catalytic acyl transfer, herbicide conjugated). The degradation process of seed germination related proteins plays an important role. Serine carboxypeptidase gene is a kind of stress resistance gene in plants, which plays an important role in plant growth and development and resistance to stress. Castor, as an important oil crop, has a wide range of applications. In this study, the 3 'and 5' end fragments of castor Rc SCP gene were cloned by c DNA terminal rapid cloning (RACE). Finally, the full length primers were designed to obtain the full length sequence of castor Rc SCP, and the bioinformatics analysis was carried out. The results showed that the c DNA complete open reading frame sequence of serine carboxypeptidase protein gene was 1377 bp, suggesting that it could encode 458amino acids, and the castor Rc SCP protein contained the conserved region of serine carboxypeptidase protein family, which was predicted to be located in the cytoplasm.
【作者單位】: 內(nèi)蒙古民族大學(xué)農(nóng)學(xué)院;內(nèi)蒙古阿魯科爾沁旗農(nóng)業(yè)局;內(nèi)蒙古民族大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;內(nèi)蒙古自治區(qū)高校蓖麻產(chǎn)業(yè)工程技術(shù)研究中心/內(nèi)蒙古自治區(qū)蓖麻育種重點實驗室/內(nèi)蒙古自治區(qū)蓖麻產(chǎn)業(yè)協(xié)同創(chuàng)新培育中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(編號:31260336) 內(nèi)蒙古自治區(qū)蓖麻育種重點實驗室開放基金(編號:MDK2016030) 內(nèi)蒙古高校蓖麻產(chǎn)業(yè)工程技術(shù)中心項目(編號:BMYJ2011007) 內(nèi)蒙古自治區(qū)高校蓖麻產(chǎn)業(yè)工程技術(shù)研究中心與軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院軍事獸醫(yī)研究所合作項目(編號:MV-201201-1)
【分類號】:S565.6

【參考文獻】

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本文編號:2490798

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