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核桃內(nèi)參基因?qū)崟r(shí)熒光定量PCR表達(dá)穩(wěn)定性評(píng)價(jià)

發(fā)布時(shí)間:2019-06-01 21:12
【摘要】:利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),結(jié)合geNorm、NormFinder和BestKeeper軟件研究了5個(gè)常用的植物內(nèi)參基因GAPDH、β-Actin、18S rRNA、UBQ和EF-1在不同基因型、不同組織、不同發(fā)育時(shí)期核桃(Juglans spp.)中的表達(dá)情況,以期篩選出在核桃中穩(wěn)定表達(dá)的內(nèi)參基因。結(jié)果顯示:GAPDH和EF-1在核桃所有樣品中均表達(dá)穩(wěn)定,由于表達(dá)豐度偏低,所以適合作為分析較低表達(dá)豐度目標(biāo)基因時(shí)的內(nèi)參;18S rRNA在核桃所有樣品中表達(dá)穩(wěn)定性較好,且18S rRNA表達(dá)豐度偏高,適合作為分析較高表達(dá)豐度目標(biāo)基因時(shí)的內(nèi)參;β-Actin和UBQ在核桃樣品中的表達(dá)穩(wěn)定性較差,不適合作為核桃中基因表達(dá)分析時(shí)的內(nèi)參基因。
[Abstract]:Using real-time fluorescence quantitative PCR and geNorm,NormFinder and BestKeeper software, five common plant reference genes GAPDH, 尾-Actin,18S rRNA,UBQ and EF-1 were studied in different genotypes, different tissues and different developmental stages of walnut (Juglans spp.). In order to screen the stable expression of internal reference genes in walnut. The results showed that GAPDH and EF-1 were stable in all walnut samples, and were suitable for the analysis of target genes with low abundance because of their low expression abundance. The expression stability of 18s rRNA in all walnut samples was good, and the expression abundance of 18s rRNA was high, which was suitable for the analysis of high abundance target genes. The expression stability of 尾-Actin and UBQ in walnut samples is poor, so it is not suitable to be used as internal reference gene in gene expression analysis of walnut.
【作者單位】: 貴州大學(xué)/貴州省果樹(shù)工程技術(shù)研究中心;
【基金】:貴州省高層次創(chuàng)新型人才培養(yǎng)項(xiàng)目(黔科合人才[2016]4038號(hào)) 貴州大學(xué)研究生創(chuàng)新基金(研農(nóng)2017019)~~
【分類號(hào)】:S664.1

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