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光皮樺miR393及其靶基因在低氮脅迫中的表達分析

發(fā)布時間:2019-05-30 13:06
【摘要】:為探討光皮樺低氮脅迫中miR393調控機制,以光皮樺(Betula luminifera)G49-3無性系為材料,分為兩組處理,低氮組以含0.03 mmol·L~(-1)NO3-的營養(yǎng)液澆灌,對照組以含15 mmol·L~(-1)KNO3的全營養(yǎng)液澆灌,分別處理1、2、4、21 d,另設一組恢復試驗組(Re),低氮處理4 d后重新添加全營養(yǎng)液。探討miR393及其靶基因(TIR1)與(AFB2)在低氮脅迫下的表達響應。應用RT-PCR和RACE技術克隆了Bl TIR1(Gen Bank登錄號:KX771075)和Bl AFB2的c DNA序列(Gen Bank登錄號:KX771074),其中Bl TIR1序列全長2 387 bp,編碼582個氨基酸,Bl AFB2序列全長2 373 bp,編碼572個氨基酸;2個基因預測的氨基酸序列中N端具有F-box保守結構域,5個LRR結構域;運用5'-RACE驗證了miR393對預測靶基因Bl TIR1和Bl AFB2的剪切作用及靶作用位點,且靶作用位點均在靶基因中從miR393 5'端起與miR393配對的第10和第11位堿基間;采用RT-q PCR分析了miR393與2個靶基因低氮脅迫時的表達模式,結果表明,miR393a相對表達量最高,可能在低氮脅迫中發(fā)揮主要調控作用。在根和葉中,miR393a表達水平在低氮處理前期(2、4 d)受到抑制,而后升高,且在恢復試驗組中,miR393a均顯著上調,且miR393a與靶基因Bl AFB2在葉中呈顯著負相關;在莖中,4 d時miR393a顯著上調而在恢復試驗組中顯著下調。miR393及其靶基因Bl TIR1和Bl AFB2在光皮樺低氮脅迫處理中的表達模式暗示其可能在低氮脅迫響應中發(fā)揮調控功能。本研究結果對于闡明光皮樺miR393—Bl TIR1/Bl AFBs在低氮脅迫響應中的調控功能,揭示林木應對低氮脅迫的分子基礎具有重要理論意義。
[Abstract]:......
【作者單位】: 省部共建亞熱帶森林培育國家重點實驗室;江西省貴溪市林業(yè)局;
【基金】:國家自然基金項目(31300566) 浙江省“十三五”林木育種專項(2016C02056-2)
【分類號】:S792.15

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