【摘要】：WRKY是一類與植物抗逆相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子,通過激活下游一系列抗逆應(yīng)答基因的表達(dá)而提高植株的綜合抗性。本研究通過基因芯片從陸地棉(Gossypium hirsutum)中篩選出一個逆境誘導(dǎo)WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因GhWRKY2,屬于Ⅱ亞組。采用RT-PCR技術(shù)獲得GhWRKY2基因cDNA全長,并對其進(jìn)行序列分析及結(jié)構(gòu)功能預(yù)測。根據(jù)GhWRKY2蛋白序列進(jìn)行同源性搜索,得到與GhWRKY2蛋白序列相似度較高的其他物種的蛋白序列,使用MEGA7軟件對GhWRKY2蛋白序列及其同源序列進(jìn)行多序列比對分析并構(gòu)建同源物種間系統(tǒng)進(jìn)化樹。利用在線工具Prot Param和Motif scan對GhWRKY2進(jìn)行氨基酸理化性質(zhì)分析;利用SMART在線工具進(jìn)行蛋白序列分析;利用SWISS-MODEL在線工具分別對GhWRKY2基因結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。結(jié)果表明,GhWRKY2核苷酸序列ORF為942 bp,編碼313個氨基酸,預(yù)測蛋白分子量為34.22 k D,等電點(diǎn)為8.76。在擬南芥原生質(zhì)體中,GhWRKY2定位于細(xì)胞核內(nèi),且具有轉(zhuǎn)錄激活活性。逆境應(yīng)答GhWRKY2基因的克隆,為進(jìn)一步從分子水平上驗證其抗逆生物學(xué)功能以及揭示棉花非生物脅迫抗逆機(jī)制奠定基礎(chǔ),并為棉花抗逆育種提供新的候選基因。
[Abstract]:WRKY is a class of transcription factors related to plant stress resistance, which improves the comprehensive resistance of plants by activating the expression of a series of downstream stress response genes. In this study, a stress-induced WRKY transcription factor gene GhWRKY2, was screened from upland cotton (Gossypium hirsutum) by gene chip, which belongs to subgroup II. The full length of GhWRKY2 gene cDNA was obtained by RT-PCR, and its sequence analysis and structure and function prediction were carried out. According to the homology search of GhWRKY2 protein sequence, the protein sequences of other species with high similarity to GhWRKY2 protein sequences were obtained. The GhWRKY2 protein sequences and their homologous sequences were analyzed by MEGA7 software and the phylogenetic tree among homologous species was constructed. The physical and chemical properties of GhWRKY2 were analyzed by online tools Prot Param and Motif scan, the protein sequence was analyzed by SMART online tool, and the structure and tertiary structure of GhWRKY2 gene were analyzed by SWISS-MODEL online tool. The results showed that the ORF of GhWRKY2 nucleotides was 942 bp, encoding 313amino acids, the predicted protein molecular weight was 34.22kD, and the isoelectric point was 8.76. the results showed that the predicted protein molecular weight was 34.22 KD and the isoelectric point was 8.76%. In Arabidopsis protoplasts, GhWRKY2 is located in the nucleus and has transcriptional activation activity. The cloning of stress response GhWRKY2 gene laid a foundation for further verifying the biological function of stress resistance and revealing the mechanism of stress resistance in cotton at the molecular level, and provided a new candidate gene for cotton stress resistance breeding.
【作者單位】： 新疆農(nóng)墾科學(xué)院棉花研究所/農(nóng)業(yè)部西北內(nèi)陸區(qū)棉花生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗室/新疆兵團(tuán)棉花遺傳改良與高產(chǎn)栽培重點(diǎn)實(shí)驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.31260360) 兵團(tuán)青年科技創(chuàng)新資金(No.2011CB001)
【分類號】：Q943.2;S562

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 李娜;;WRKY耐逆研究進(jìn)展[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年13期

2 ;PKS5,a SNF1-related kinase,interacts with and phosphorylates NPR1,and modulates expression of WRKY38 and WRKY62[J];遺傳學(xué)報;2010年06期

3 郝林,徐昕;植物轉(zhuǎn)錄因子WRKY家族的結(jié)構(gòu)及功能[J];植物生理學(xué)通訊;2004年02期

4 仇玉萍,荊邵娟,付堅,李璐,余迪求;13個水稻W(wǎng)RKY基因的克隆及其表達(dá)譜分析[J];科學(xué)通報;2004年18期

5 李蕾,謝丙炎,戴小楓,楊宇紅;WRKY轉(zhuǎn)錄因子及其在植物防御反應(yīng)中的作用[J];分子植物育種;2005年03期

6 ;Leucine zipper like structure in rice WRKY89 enhances its affinity for binding with W box elements[J];Chinese Science Bulletin;2005年10期

7 王海華,郝中娜,謝科,吳坤陸,郭澤建;水稻W(wǎng)RKY89中的亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)增強(qiáng)蛋白與W盒元件的相互作用[J];科學(xué)通報;2005年10期

8 高國慶,儲成才,劉小強(qiáng),李楊瑞;植物WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族研究進(jìn)展[J];植物學(xué)通報;2005年01期

9 劉戈宇;胡鳶雷;祝建波;;植物WRKY蛋白家族的結(jié)構(gòu)及其功能[J];生命的化學(xué);2006年03期

10 ;Transcription Factor WRKY70 Displays Important but No Indispensable Roles in Jasmonate and Salicylic Acid Signaling[J];Journal of Integrative Plant Biology;2008年05期

相關(guān)會議論文 前10條

1 郝俊杰;王海華;陳旭君;郝中娜;郭澤建;;水稻W(wǎng)RKY89參與水稻對紫外B的耐受性[A];中國植物病理學(xué)會2006年學(xué)術(shù)年會論文集[C];2006年

2 孫清鵬;王麗芳;于涌鯤;萬善霞;郝玉蘭;;番茄WRKY基因的克隆[A];中國植物病理學(xué)會2009年學(xué)術(shù)年會論文集[C];2009年

3 梁姍姍;于涌鯤;王麗芳;趙福寬;杜希華;孫清鵬;;茉莉酸誘導(dǎo)的番茄WRKY克隆[A];中國植物生理學(xué)會第十次會員代表大會暨全國學(xué)術(shù)年會論文摘要匯編[C];2009年

4 陳益芳;徐謙;王慧;武維華;;擬南芥WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物響應(yīng)低磷脅迫中的功能分析[A];中國植物學(xué)會植物細(xì)胞生物學(xué)2010年學(xué)術(shù)年會論文摘要匯編[C];2010年

5 ;Increased Expression of Rice WRKY30 Gene Enhances Resistance to Sheath Blight and Blast Fungi in Rice[A];中國植物病理學(xué)會2011年學(xué)術(shù)年會論文集[C];2011年

6 王晨;劉磊;姚凝聰;譚翼;馬會;王夏天;何光源;楊廣笑;;小麥WRKY基因的克隆、表達(dá)分析及其遺傳轉(zhuǎn)化[A];中國的遺傳學(xué)研究——遺傳學(xué)進(jìn)步推動中國西部經(jīng)濟(jì)與社會發(fā)展——2011年中國遺傳學(xué)會大會論文摘要匯編[C];2011年

7 ;A group of conserved SPTT domain containing WRKY transcription factors are potential substrates of MAP kinases in plants[A];第六屆中國植物逆境生理學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)術(shù)研討會論文摘要匯編[C];2010年

8 余迪求;陳利鋼;胡彥如;;擬南芥WRKY8調(diào)控植物多種逆境信號通路[A];中國遺傳學(xué)會第九次全國會員代表大會暨學(xué)術(shù)研討會論文摘要匯編（2009-2013）[C];2013年

9 鄒長松;江文波;余迪求;;擬南芥雄配子特異表達(dá)的WRKY34基因負(fù)調(diào)控成熟花粉抗冷性[A];中國的遺傳學(xué)研究——遺傳學(xué)進(jìn)步推動中國西部經(jīng)濟(jì)與社會發(fā)展——2011年中國遺傳學(xué)會大會論文摘要匯編[C];2011年

10 REN Yujun;JIANG Jingjing;ZHAO Ziwei;HUANG Dongmei;MIAO Ying;;The single-stranded DNA binding protein WHIRLY1 represses WRKY53 expression and delays leaf senescence in a developmental stage-dependent manner in Arabidopsis thaliana[A];2013全國植物生物學(xué)大會論文集[C];2013年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 劉飛;大麥草酸氧化酶與WRKY轉(zhuǎn)錄因子參與調(diào)控核盤菌抗性的分子機(jī)理[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

2 劉秀芳;棉花GhWRKY25基因的克隆及功能分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

3 王敏;葡萄WRKY和VQ基因家族的全基因組鑒定、表達(dá)分析及蛋白互作預(yù)測[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

4 竇玲玲;棉花衰老相關(guān)WRKY基因的克隆與功能分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

5 金晶;玉米逆境響應(yīng)相關(guān)基因ZmUBP的功能鑒定與WRKY基因家族進(jìn)化分析[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

6 黃蕓;擬南芥WRKY6和PHO1參與ABA調(diào)控種子萌發(fā)和早期幼苗生長過程的分子機(jī)制[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

7 謝科;水稻W(wǎng)RKY10基因的功能研究[D];浙江大學(xué);2005年

8 沈懷舜;WRKY家族調(diào)控植物抗逆信號途徑分子機(jī)制的初步研究[D];復(fù)旦大學(xué);2007年

9 于延沖;擬南芥轉(zhuǎn)錄因子WRKY71對花和分枝發(fā)育的調(diào)控機(jī)制研究[D];山東大學(xué);2011年

10 王慧;擬南芥WRKY45轉(zhuǎn)錄因子參與響應(yīng)低磷脅迫的實(shí)驗證據(jù)[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 賈翠玲;葡萄WRKY基因超家族的進(jìn)化分析[D];遼寧師范大學(xué);2010年

2 Abdul Karim;[D];西南大學(xué);2015年

3 王繼穎;楊樹應(yīng)答鹽脅迫WRKY基因的篩選及功能分析[D];東北林業(yè)大學(xué);2015年

4 嚴(yán)俊;玉米轉(zhuǎn)錄因子ZmWRKY19基因的克隆及功能研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年

5 馮虎;刺葡萄0943抗白腐病WRKY調(diào)控因子功能分析[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

6 趙曾強(qiáng);棉花GhWRKY44和GhWRKY22基因的克隆及功能初步分析[D];石河子大學(xué);2015年

7 楊明澤;番茄ShWRKY6基因的抗逆功能研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

8 喬丹娜;玫瑰黃鏈霉菌誘導(dǎo)黃瓜抗線相關(guān)WRKY基因的表達(dá)分析及其藥效試驗[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

9 楊爍;水稻W(wǎng)RKY68在Xa21介導(dǎo)的抗病途徑中的功能研究[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

10 龔巧巧;水稻轉(zhuǎn)錄因子WRKY22在鋁脅迫應(yīng)答中的功能研究[D];浙江大學(xué);2015年

，

本文編號：2473965