【摘要】：為了研究中國(guó)美利奴羊TOLL樣受體(TLR4)基因第3外顯子上的單核苷酸多態(tài)性(SNPS)和單氨基酸多態(tài)性(SAPS)。利用生物信息學(xué)方法對(duì)NCBI上公布的有關(guān)綿羊的TLR4序列進(jìn)行下載并用Seq Man對(duì)下載的綿羊TLR4基因外顯子進(jìn)行多態(tài)性比對(duì)分析,然后采用PCR-SSCP并結(jié)合測(cè)序的方法對(duì)119只中國(guó)美利奴羊TLR4基因的外顯子3的擴(kuò)增片段進(jìn)行分析。通過(guò)分析發(fā)現(xiàn),在中國(guó)美利奴羊第3外顯子1 180 bp處有1個(gè)突變位點(diǎn),由G突變成T,氨基酸由天冬氨酸(D)變成酪氨酸(Y),即該位點(diǎn)為有義突變。在1 537 bp處也有1個(gè)突變位點(diǎn),即由G突變成了A,氨基酸由丙氨酸(A)變成蘇氨酸(T),在TLR4第3外顯子的其他位點(diǎn)并沒(méi)有SNPS位點(diǎn),說(shuō)明中國(guó)美利奴羊TLR4基因上的第3外顯子區(qū)域有2個(gè)多態(tài)位點(diǎn)。
[Abstract]:To study the single nucleotide polymorphism (SNPS) and single amino acid polymorphism (SAPS).) on exon 3 of TOLL-like receptor (TLR4) gene in Chinese Merino sheep The published TLR4 sequences of sheep on NCBI were downloaded by bioinformatics method, and the polymorphism of the downloaded exon of TLR4 gene in sheep was analyzed by Seq Man. Then the amplified fragment of exon 3 of TLR4 gene was analyzed by PCR-SSCP and sequencing in 119 Chinese Merino sheep. It was found that there was a mutation site in exon 1 180 bp of Chinese Merino sheep, from G mutation to T mutation, and amino acid from aspartic acid (D) to tyrosine (Y), that is, a sense mutation. There was also a mutation site at 1537 bp, that is, the mutation from G to A, and the amino acid from alanine (A) to threonine (T), did not have a SNPS site at the other sites of TLR4 exon 3. The results showed that there were two polymorphic sites in exon 3 of TLR4 gene in Chinese Merino sheep.
【作者單位】： 石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家“973”計(jì)劃(編號(hào):2010CB530200)
【分類號(hào)】：S826.86

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本文編號(hào)：2450923