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人參生長(zhǎng)素極性運(yùn)輸基因PIN的表達(dá)譜研究

發(fā)布時(shí)間:2019-03-27 13:46
【摘要】:生長(zhǎng)素極性運(yùn)輸基因PIN(PIN-FORMED)決定了植物中生長(zhǎng)素濃度梯度分布,參與多種發(fā)育及次生代謝過程。本研究采用轉(zhuǎn)錄組熱圖聚類方法分析了4年生吉林人參14個(gè)不同部位PIN2、PIN3及PIN6的表達(dá)譜,結(jié)果顯示PgPIN2與PgPIN6主要在人參地下根與根莖中表達(dá),PgPIN3在人參的葉子、果實(shí)及根中均有很高的表達(dá);采用序列同源比對(duì)、RT-PCR擴(kuò)增測(cè)序及生物信息學(xué)分析方法,確認(rèn)了人參3個(gè)PIN基因成員PgPIN2、PgPIN3與PgPIN6;采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)分析人參不定根、組培苗不同部位的表達(dá)模式,發(fā)現(xiàn)PgPIN3與PgPIN6在人參不定根根尖表達(dá)高,PgPIN2在人參組培苗根部表達(dá)高,PgPIN3在人參組培苗的葉中表達(dá)高。人參PIN基因的組織特異性表達(dá)表明PgPIN2、PgPIN3與PgPIN6對(duì)根的生長(zhǎng)發(fā)育及向性生長(zhǎng)很可能具有相應(yīng)的功能,PIN3對(duì)人參植株地上部分的生長(zhǎng)具有較重要的意義,可為后期深入挖掘其對(duì)人參向性生長(zhǎng)等功能奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:The polar transport gene PIN (PIN-FORMED) determines the gradient distribution of auxin concentration in plants and participates in a variety of developmental and secondary metabolic processes. In this study, the expression profiles of PIN2,PIN3 and PIN6 in 14 different parts of 4-year-old Ginseng were analyzed by means of transcript group thermal map clustering method. The results showed that PgPIN2 and PgPIN6 were mainly expressed in underground roots and rhizomes of Ginseng, and PgPIN3 was expressed in leaves of Ginseng. High expression was found in fruits and roots. Three PIN gene members of Ginseng, PgPIN2,PgPIN3 and PgPIN6;, were confirmed by sequence homology alignment, RT-PCR amplification and bioinformatics analysis. The expression patterns of adventitious roots and tissue cultured seedlings of Ginseng were analyzed by real-time fluorescence quantitative PCR. It was found that the expression of PgPIN3 and PgPIN6 was high at the root tip of adventitious root of Ginseng, the expression of PgPIN2 was high at the root of adventitious root of Ginseng, and the expression of PgPIN3 was high in the leaves of tissue-cultured seedlings of Ginseng. The tissue-specific expression of PIN gene indicates that PgPIN2,PgPIN3 and PgPIN6 may have corresponding functions to the growth and development of roots, and PIN3 is of great significance to the growth of above-ground parts of Ginseng, and it is very important for the growth of above-ground parts of Ginseng plants. It can lay a foundation for further excavating the function of Ginseng growth in the later stage.
【作者單位】: 中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院中藥資源中心;中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院特產(chǎn)研究所;中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81603235) 國(guó)家杰出青年科學(xué)基金項(xiàng)目(81325023) 名貴中藥資源可持續(xù)利用能力建設(shè)項(xiàng)目(2060302) 中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院中藥資源中心自主選題研究項(xiàng)目課題(ZZ2016006)
【分類號(hào)】:S567.51

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2448238

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