【摘要】：查爾酮異構(gòu)酶(CHI)是類黃酮生物合成過程中的關(guān)鍵酶之一,其在類黃酮的合成過程中發(fā)揮著非常重要的作用。本研究以日本蛇根草為研究材料,根據(jù)其轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果設(shè)計(jì)全長引物,通過RT-PCR方法成功克隆得到日本蛇根草查爾酮異構(gòu)酶基因完整的cDNA序列,并對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,該基因序列全長為702 bp,編碼233個氨基酸,預(yù)測其蛋白分子量為25.018 k D,等電點(diǎn)為4.95,是親水性蛋白質(zhì),不含有信號肽,很可能定位在葉綠體基質(zhì)中。同時(shí),二級結(jié)構(gòu)分析顯示,日本蛇根草CHI的二級結(jié)構(gòu)分別由96個α螺旋、51個延伸鏈、86個無規(guī)則卷曲組成,這與三維結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果相一致。日本蛇根草CHI基因的克隆對于研究植物類黃酮的生物合成及其分子機(jī)制具有重要意義,同時(shí)也豐富了雙子葉植物CHI基因家族的相關(guān)研究。
[Abstract]:Chalcone isomerase (CHI) is one of the key enzymes in the biosynthesis of flavonoids, which plays a very important role in the synthesis of flavonoids. In this study, the complete cDNA sequence of chalcone isomerase gene of Japanese snake root grass was successfully cloned by RT-PCR, and the full length primers were designed according to the sequencing results of its transcript group, and the complete DNA sequence of Chalcone isomerase gene was obtained by PCR. Bioinformatics analysis was carried out. The results showed that the full length of the gene was 702 bp, encoding 233amino acids. The predicted molecular weight of the protein was 25.018 KD and isoelectric point was 4.95. It was a hydrophilic protein with no signal peptide and probably located in chloroplast matrix. At the same time, the secondary structure analysis showed that the secondary structure of CHI was composed of 96 偽 helices, 51 extended chains and 86 irregular curls, which was consistent with the prediction results of three dimensional structures. The cloning of CHI gene is of great significance for studying the biosynthesis and molecular mechanism of flavonoids, and it also enriches the study of CHI gene family in dicotyledonous plants.
【作者單位】： 貴州師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院植物生理與發(fā)育調(diào)控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;貴陽中醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院;
【基金】：貴州師范大學(xué)資助博士科研項(xiàng)目(0516006) 貴州省聯(lián)合基金項(xiàng)目(黔科合LH字[2015]7777號) 貴州省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室建設(shè)項(xiàng)目(黔科合計(jì)Z字[2011]4005)共同資助
【分類號】：Q943.2

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本文編號：2445812