【摘要】：CBL、CIPK作為鈣離子介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路上的重要蛋白在植物逆境應(yīng)答和生長(zhǎng)發(fā)育過程中發(fā)揮著重要的作用。本研究通過本地t BLASTn鑒定出辣椒中CBL、CIPK基因家族成員序列信息;運(yùn)用MEGA程序構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹;利用GSDS程序?qū)蚪Y(jié)構(gòu)保守性進(jìn)行分析、MEME程序進(jìn)行基序分析以及UGENE、plant CARE軟件對(duì)順勢(shì)作用元件進(jìn)行了分析,顯示9個(gè)辣椒CBL基因,21個(gè)辣椒CIPK基因分別分布于不同的染色體上,Ca CBL基因內(nèi)含子個(gè)數(shù)保守為7~9個(gè);Ca CIPK基因分為多內(nèi)含子(11~14)和少內(nèi)含子(0~1)兩類。在辣椒CBL基因和CIPK基因的上游1 000 bp序列中存在多個(gè)應(yīng)答不同逆境和植物激素的順式作用元件且種類和數(shù)目各不相同。相互作用預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),辣椒CBL-CIPK可能存在多個(gè)相互作用通路。本研究可為進(jìn)一步研究辣椒CBL、CIPK基因的功能以及辣椒中CBL-CIPK介導(dǎo)的Ca~(2+)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路提供有益參考。
[Abstract]:As an important protein in calcium-mediated signal transduction pathway, CBL,CIPK plays an important role in plant stress response and growth and development. In this study, the sequence information of CBL,CIPK gene family members in capsicum was identified by local t-BLASTn, and phylogenetic tree was constructed by MEGA program. GSDS program was used to analyze the conservatism of gene structure, MEME program was used for motif analysis and UGENE,plant CARE software was used for analysis of homeopathic elements. Nine CBL genes were found in pepper (Capsicum annuum L.). The number of introns of, Ca CBL gene in 21 capsicum peppers distributed on different chromosomes was conserved to 7? 9? Ca CIPK gene is divided into two types: polyintron (11 / 14) and few intron (0 / 1). There are several cis-acting elements that respond to different stresses and plant hormones in the upstream 1 000 bp sequence of CBL gene and CIPK gene in pepper, and the species and number of them are different. The interaction prediction showed that there might be multiple interaction pathways in pepper CBL-CIPK. This study may provide a useful reference for further study on the function of CBL,CIPK gene and CBL-CIPK-mediated Ca~ (2) signal transduction pathway in capsicum.
【作者單位】： 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝園林學(xué)院;東北農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：黑龍江省杰出青年基金(JC2015004) 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)校青年才俊計(jì)劃(14QC11)共同資助
【分類號(hào)】：Q943.2;S641.3

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本文編號(hào)：2442211