【摘要】：采用信號(hào)處理技術(shù)來識(shí)別DNA堿基序列中的基因片段的方法,已經(jīng)成為一種重要的基因識(shí)別途徑,重新編碼的DNA序列存在大量噪聲信息,使得目前很多識(shí)別算法無法準(zhǔn)確的識(shí)別外顯子片段的起始位置。本研究通過對(duì)"固定長(zhǎng)度滑動(dòng)窗口-頻譜曲線法"和"移動(dòng)序列-信噪比法"的實(shí)現(xiàn)與改進(jìn),提出了一種基于變動(dòng)窗口和移動(dòng)序列的基因識(shí)別算法。首先,對(duì)已有基因識(shí)別算法進(jìn)行編程實(shí)現(xiàn);采用小波分析對(duì)識(shí)別結(jié)果進(jìn)行消噪處理;探討識(shí)別最優(yōu)固定長(zhǎng)度M的選擇,提出基于變動(dòng)窗口和移動(dòng)序列的基因預(yù)測(cè)模型,并編程實(shí)現(xiàn)。最后使用該模型對(duì)已有基因序列進(jìn)行識(shí)別,其識(shí)別準(zhǔn)確度達(dá)到77.57%。
[Abstract]:The method for identifying the gene segment in the DNA base sequence by adopting the signal processing technology has become an important gene recognition way, and the re-encoded DNA sequence has a large amount of noise information, so that the present many identification algorithms can not accurately identify the starting position of the exon fragments. Through the realization and improvement of the "fixed-length sliding window-spectrum curve method" and the "mobile sequence-to-noise ratio method", a genetic identification algorithm based on the change window and the moving sequence is proposed. First, the existing gene recognition algorithm is programmed and realized; the recognition result is de-noising by using the small wave analysis; the selection of the optimal fixed length M is discussed, and a gene prediction model based on the change window and the moving sequence is proposed, and the realization is realized. Finally, this model was used to identify the existing gene sequence, and the recognition accuracy was 77. 57%.
【作者單位】： 首都師范大學(xué)資源環(huán)境與旅游學(xué)院;首都師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(41171335)資助
【分類號(hào)】：Q811.4

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本文編號(hào)：2430033