【摘要】：為明確蒙古冰草抗旱相關(guān)microRNA(miRNA)的表達(dá)特征及其靶基因,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),對(duì)前期測序篩選到的4個(gè)miRNA(amo-miR21、amo-miR44、amo-miR62、amo-miR82)在干旱脅迫下的苗期差異表達(dá)情況進(jìn)行了定量驗(yàn)證,用Target Finder軟件和psRNATarget數(shù)據(jù)庫在線預(yù)測其靶基因,并用MegAlign軟件對(duì)預(yù)測的靶基因進(jìn)行了同源性比對(duì)分析。結(jié)果表明,干旱脅迫下,蒙古冰草中amo-miR21、amo-miR82和amo-miR62的表達(dá)量呈上調(diào)趨勢,而amo-miR44的表達(dá)呈下調(diào)趨勢,與前期測序結(jié)果相符;4個(gè)miRNA共預(yù)測出32個(gè)靶基因,其中,amo-miR44在玉米、水稻和小麥數(shù)據(jù)庫中未發(fā)現(xiàn)同源的靶基因,在擬南芥、大麥、蒺藜苜蓿中發(fā)現(xiàn)的靶基因相似性較低;而amo-miR21、amo-miR82和amo-miR62的靶基因均與小麥中預(yù)測的靶基因存在較高同源性(68.6%~95.6%),推測這3個(gè)靶基因是參與干旱逆境脅迫響應(yīng)的基因。
[Abstract]:In order to identify the expression characteristics and target genes of microRNA (miRNA) related to drought resistance, four miRNA (amo-miR21,amo-miR44,amo-miR62,) were screened by real-time fluorescence quantitative PCR. Amo-miR82) was quantitatively verified in seedling stage of drought stress. Target Finder and psRNATarget database were used to predict the target gene online. The homology of the predicted target gene was analyzed by MegAlign software. The results showed that under drought stress, the expression of amo-miR21,amo-miR82 and amo-miR62 was up-regulated, while the expression of amo-miR44 was down-regulated, which was consistent with the results of previous sequencing. Among the 32 target genes predicted by four miRNA, no homologous target genes were found in maize, rice and wheat databases, but the similarity of target genes in Arabidopsis thaliana, barley and Tribulus terrestris was low. The target genes of amo-miR21,amo-miR82 and amo-miR62 were highly homologous to the target genes predicted in wheat (68.6% or 95.6%), which suggested that the three target genes were involved in drought stress response.
【作者單位】： 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31360573)
【分類號(hào)】：S543.9

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本文編號(hào)：2424003