鐵皮石斛RCA2基因克隆與生物信息學分析
[Abstract]:Ribonose 5-diphosphate carboxylase / oxygenase is the key enzyme of photosynthetic carbon assimilation. It plays a direct role in regulating Rubisco activity and photosynthetic rate of Dendrobium candidum. It will lay a good foundation for changing the photosynthetic rate of plants. In this study, the Rubisco activase (RCA) gene was cloned from the annual leaves of Dendrobium candidum by RT-PCR and RACE techniques, and its bioinformatics analysis was carried out. The results showed that the whole length of RCA gene was 1 730 bp, named RCA2 (Gen Bank accession number KT205842), in which 5'-UTR 81 bp,3'-UTR 326 bp, open reading frame 1 323 bp, encodes 440 amino acids with molecular weight of 48.53 k Da,. The isoelectric point is 6.19, which contains the gene structure of P-loop NTPase superfamily. Amino acid multiple sequence alignment showed that the similarity between RCA2 nucleotide sequence and Phalaenopsis was as high as that of 87%.RCA2 coding protein was hydrophilic, and subcell was located in chloroplast matrix. In protein secondary structure analysis, 偽 helix accounted for 30.68%, extension chain 25.45%, irregular folding accounted for the function prediction of protein encoded by 43.86%.RCA2, and RCA2 played a very important role in intermediate metabolism. It was found that the analysis of Rubisco, a key enzyme in photosynthesis of Dendrobium candidum, could provide a theoretical basis for exploring its photosynthesis characteristics and improving the efficiency of greenhouse cultivation.
【作者單位】: 鄭州師范學院生物工程研究所;河南農(nóng)業(yè)大學生命科學學院;
【基金】:河南省教育廳重點科研項目(14B180036) 鄭州市科技發(fā)展計劃項目(20150448) 鄭州市重大科技專項(141PZDZX038)~~
【分類號】:S567.239
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