發(fā)布時間：2019-01-06 11:41

【摘要】：紫色酸性磷酸酶(purple acid phosphatases,PAPs)屬于金屬磷酸酯酶家族,參與了植物大量的生理反應,特別是磷素的吸收與利用。本研究利用已經(jīng)發(fā)表的辣椒基因組數(shù)據(jù),采用同源比對方法對辣椒PAP基因家族進行鑒定與表達分析。通過鑒定發(fā)現(xiàn)辣椒基因組中至少含有25個PAP基因成員,氨基酸序列長度在264~639 aa,具有1~12個內(nèi)含子,不均勻地分布在12條染色體上,僅發(fā)現(xiàn)1對基因以串聯(lián)重復的形式存在。系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系表明,辣椒、擬南芥和水稻PAP基因家族成員可以分為3個家族,8個亞家族,每個家族成員的數(shù)目是變異的,而且存在6對直系同源基因和20對旁系同源基因,這表明PAP基因家族的存在早于辣椒、擬南芥和水稻的分化�；赗NA-seq數(shù)據(jù)庫和q RT-PCR方法,對辣椒PAP基因的組織表達及果實發(fā)育的不同時期進行分析,結(jié)果表明PAP家族基因具有組織表達特異性和發(fā)育時期表達特異性。
[Abstract]:Purple acid phosphatase (purple acid phosphatases,PAPs) belongs to the family of metal phosphatase, which is involved in a large number of physiological responses of plants, especially the absorption and utilization of phosphorus. In this study, the PAP gene family of capsicum was identified and expressed by using the published genomic data of capsicum (Capsicum capsicum). It was found that there were at least 25 members of PAP gene in the genome of capsicum. The amino acid sequence was 264n639 aa, with 1 ~ 12 introns, which was unevenly distributed on 12 chromosomes. Only one pair of genes was found to exist in the form of tandem repeats. Phylogenetic relationships showed that the members of PAP gene family of pepper, Arabidopsis thaliana and rice could be divided into 3 families, 8 subfamilies. The number of members of each family was variable, and there were 6 pairs of lineal homologous genes and 20 pairs of sequentially homologous genes. This indicated that the PAP gene family existed earlier than the differentiation of pepper, Arabidopsis and rice. Based on RNA-seq database and Q RT-PCR method, the tissue expression of PAP gene and fruit development of pepper were analyzed. The results showed that PAP family gene had tissue expression specificity and developmental stage expression specificity.
【作者單位】： 蘇州農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學院;浙江省植物有害生物防控重點實驗室—省部共建國家重點實驗室培育基地浙江省農(nóng)業(yè)科學院蔬菜研究所;衢州市農(nóng)業(yè)科學研究院;江蘇沿海地區(qū)農(nóng)業(yè)科學研究所;
【基金】：江蘇省自然科學基金青年基金項目(BK20140277) 蘇州市科技發(fā)展計劃項目應用基礎(chǔ)研究(SYN201418) 蘇州農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學院青年教師科研能力提升計劃資助項目(PPN201308) 浙江省自然科學基金(LQ15C150002) 國家自然科學基金(31501749);國家自然科學基金青年人才培養(yǎng)計劃(2015R23R08E07,2015R23R08E09) 國家重點實驗室開放項目(2010DS700124-KF1517)
【分類號】：S641.3

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本文編號：2402745