【摘要】：紫色酸性磷酸酶(purple acid phosphatases,PAPs)屬于金屬磷酸酯酶家族,參與了植物大量的生理反應(yīng),特別是磷素的吸收與利用。本研究利用已經(jīng)發(fā)表的辣椒基因組數(shù)據(jù),采用同源比對方法對辣椒PAP基因家族進(jìn)行鑒定與表達(dá)分析。通過鑒定發(fā)現(xiàn)辣椒基因組中至少含有25個PAP基因成員,氨基酸序列長度在264~639 aa,具有1~12個內(nèi)含子,不均勻地分布在12條染色體上,僅發(fā)現(xiàn)1對基因以串聯(lián)重復(fù)的形式存在。系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系表明,辣椒、擬南芥和水稻PAP基因家族成員可以分為3個家族,8個亞家族,每個家族成員的數(shù)目是變異的,而且存在6對直系同源基因和20對旁系同源基因,這表明PAP基因家族的存在早于辣椒、擬南芥和水稻的分化�；赗NA-seq數(shù)據(jù)庫和q RT-PCR方法,對辣椒PAP基因的組織表達(dá)及果實(shí)發(fā)育的不同時期進(jìn)行分析,結(jié)果表明PAP家族基因具有組織表達(dá)特異性和發(fā)育時期表達(dá)特異性。
[Abstract]:Purple acid phosphatase (purple acid phosphatases,PAPs) belongs to the family of metal phosphatase, which is involved in a large number of physiological responses of plants, especially the absorption and utilization of phosphorus. In this study, the PAP gene family of capsicum was identified and expressed by using the published genomic data of capsicum (Capsicum capsicum). It was found that there were at least 25 members of PAP gene in the genome of capsicum. The amino acid sequence was 264n639 aa, with 1 ~ 12 introns, which was unevenly distributed on 12 chromosomes. Only one pair of genes was found to exist in the form of tandem repeats. Phylogenetic relationships showed that the members of PAP gene family of pepper, Arabidopsis thaliana and rice could be divided into 3 families, 8 subfamilies. The number of members of each family was variable, and there were 6 pairs of lineal homologous genes and 20 pairs of sequentially homologous genes. This indicated that the PAP gene family existed earlier than the differentiation of pepper, Arabidopsis and rice. Based on RNA-seq database and Q RT-PCR method, the tissue expression of PAP gene and fruit development of pepper were analyzed. The results showed that PAP family gene had tissue expression specificity and developmental stage expression specificity.
【作者單位】： 蘇州農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院;浙江省植物有害生物防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室—省部共建國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所;衢州市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院;江蘇沿海地區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所;
【基金】：江蘇省自然科學(xué)基金青年基金項目(BK20140277) 蘇州市科技發(fā)展計劃項目應(yīng)用基礎(chǔ)研究(SYN201418) 蘇州農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院青年教師科研能力提升計劃資助項目(PPN201308) 浙江省自然科學(xué)基金(LQ15C150002) 國家自然科學(xué)基金(31501749);國家自然科學(xué)基金青年人才培養(yǎng)計劃(2015R23R08E07,2015R23R08E09) 國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放項目(2010DS700124-KF1517)
【分類號】：S641.3

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 梁東;吳釤;王素芳;馬鋒旺;;蘋果山梨醇脫氫酶基因家族的克隆及表達(dá)分析[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2012年01期

2 張波;李鮮;陳昆松;;脂氧合酶基因家族成員與果實(shí)成熟衰老研究進(jìn)展[J];園藝學(xué)報;2007年01期

3 張波;李鮮;陳昆松;;基于EST庫的獼猴桃脂氧合酶基因家族成員的克隆[J];園藝學(xué)報;2008年03期

4 張波;徐昌杰;陳昆松;;獼猴桃6個LOX基因家族成員實(shí)時定量PCR引物特異性的檢測與應(yīng)用[J];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報;2008年03期

5 張春華;上官凌飛;俞明亮;張彥蘋;馬瑞娟;;桃NAC基因家族生物信息學(xué)分析[J];江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報;2012年02期

6 萬紅建;袁偉;俞錁;劉云飛;李志邈;葉青靜;王榮青;阮美穎;周國治;姚祝平;楊悅儉;;番茄SBP基因家族的全基因組鑒定、結(jié)構(gòu)特征及表達(dá)分析[J];分子植物育種;2013年03期

7 王萱;吳波;程春振;姜波;鐘廣炎;;甜橙乙烯誘導(dǎo)酯酶基因家族的進(jìn)化[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2014年10期

8 王小非;劉鑫;蘇玲;孫永江;張世忠;郝玉金;由春香;;番茄LBD基因家族的全基因組序列鑒定及其進(jìn)化和表達(dá)分析[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年12期

9 巴德仁貴;趙乾;任鳳蕊;馬勇;哈斯阿古拉;;甜瓜持綠蛋白基因家族的全基因組鑒定及進(jìn)化分析[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2014年13期

10 龔明;譚琦;陳明杰;鮑大鵬;汪虹;;基于全基因組系統(tǒng)發(fā)生的草菇基因家族顯著擴(kuò)增[J];微生物學(xué)報;2014年09期

相關(guān)會議論文 前1條

1 郁有健;呂美玲;梁穎;曹家樹;;白菜多聚半乳糖醛酸酶基因家族成員的結(jié)構(gòu)、進(jìn)化與定位分析[A];中國園藝學(xué)會十字花科蔬菜分會第十屆學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2012年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前5條

1 呂美玲;甘藍(lán)和白菜PG基因家族成員的比較BoMF25和BcMF26的功能鑒定[D];浙江大學(xué);2015年

2 王潔;植物MAPK級聯(lián)途徑基因家族的進(jìn)化分析及番茄SlMPK13的功能鑒定[D];浙江大學(xué);2015年

3 張沖;甜瓜脂氧合酶基因家族成員鑒定、表達(dá)調(diào)控及CmLOX8在果實(shí)香氣合成中的作用[D];沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

4 丁安明;番茄與煙草PPR基因家族分析及育性相關(guān)基因功能研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2014年

5 靳亞忠;甜瓜醇脫氫酶基因家族成員鑒定、分類及表達(dá)調(diào)控[D];沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前8條

1 文歡;獼猴桃抗?jié)儾』虻纳镄畔W(xué)分析[D];浙江大學(xué);2016年

2 李斯貝;柑橘生長素響應(yīng)因子ARF基因家族的表達(dá)分析及功能驗(yàn)證[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

3 宋雯;葡萄ACO和ETR基因家族的時空表達(dá)特性分析[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年

4 降昀;草莓FvCKX基因家族的進(jìn)化分析及其表達(dá)特異性研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

5 李換桃;山梨醇轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因家族的克隆及其表達(dá)分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2010年

6 張濤;桃脂氧合酶基因家族cDNA全長克隆與功能分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2009年

7 王萱;甜橙乙烯誘導(dǎo)酯酶基因家族的進(jìn)化和表達(dá)分析[D];西南大學(xué);2014年

8 楊蔚然;番茄ANT基因家族的鑒定及SlAIL1-2基因的功能研究[D];重慶大學(xué);2014年

，

本文編號：2402745