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綿刺肌動(dòng)蛋白基因的分離及特性分析

發(fā)布時(shí)間:2018-12-10 23:23
【摘要】:本研究采用兼并PCR(polymerase chain reaction)和RACE(rapid amplification of cDNA ends)技術(shù)分離了綿刺(Potaninia mongolica Maxim.)肌動(dòng)蛋白基因(Actin,Pm Actin)c DNA序列,該序列包含有1 134 bp的開(kāi)放閱讀框(open reading frame,ORF),編碼377個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)蛋白分子量為41.8 k D,理論等電點(diǎn)為5.48;基因組DNA序列長(zhǎng)度為1 134 bp,無(wú)內(nèi)含子。該序列與其他植物Actin的一致性較高,核苷酸均高于88%,氨基酸則均高于96%。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示:Pm Actin與同屬薔薇科的草莓、碧桃,扁桃和薔薇及葡萄科的葡萄Actin蛋白聚為一個(gè)亞類,與草莓Actin蛋白親緣關(guān)系最為接近。RT-PCR分析顯示,該基因在根、莖、葉中的表達(dá)量無(wú)明顯變化,該結(jié)果驗(yàn)證了Pm Actin基因可作為分子內(nèi)標(biāo)的可靠性,為深入開(kāi)展該植物的分子生物學(xué)研究提供理論依據(jù)。
[Abstract]:In this study, (Potaninia mongolica Maxim.) was separated by merging PCR (polymerase chain reaction) and RACE (rapid amplification of cDNA ends) techniques. Actin gene (Actin,Pm Actin) c DNA sequence, which contains an open reading frame (open reading frame,ORF of 1 134 bp), encodes 377 amino acids, the predicted molecular weight is 41.8 KD and the theoretical isoelectric point is 5.48; The length of genomic DNA sequence was 1 134 bp, without intron. The sequence was consistent with other plant Actin, the nucleotides were higher than 88 and amino acids were higher than 96. Phylogenetic analysis showed that: Pm Actin was clustered into a subclass of Actin protein of strawberry, bisporus, almond, rose and grape family, which was most closely related to Actin protein of strawberry. RT-PCR analysis showed that the gene was located in root and stem. There was no significant change in the expression of Pm Actin gene in leaves, which confirmed the reliability of Pm Actin gene as a molecular marker, and provided a theoretical basis for the further study of molecular biology of the plant.
【作者單位】: 內(nèi)蒙古大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31360063) 內(nèi)蒙古科技計(jì)劃項(xiàng)目(20140707)共同資助
【分類號(hào)】:Q946.1

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2371402

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