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羅漢果色氨酸轉(zhuǎn)氨酶基因SgTAR2的克隆及表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-11-27 06:36
【摘要】:色氨酸轉(zhuǎn)氨酶基因家族,是直接參與植物生長(zhǎng)素生物合成途徑的關(guān)鍵酶基因。該研究在羅漢果轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的基礎(chǔ)上,結(jié)合RACE技術(shù)克隆羅漢果色氨酸轉(zhuǎn)氨酶基因SgTAR2的全長(zhǎng)cDNA序列和DNA序列;并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析和時(shí)空表達(dá)分析。結(jié)果表明:克隆所得SgTAR2的cDNA全長(zhǎng)序列2078bp,最長(zhǎng)ORF為1332bp,編碼443個(gè)氨基酸,Gen Bank登錄號(hào)為KU949381,其編碼蛋白具有2個(gè)蒜氨酸酶保守結(jié)構(gòu)域和多個(gè)5'-PLP結(jié)合位點(diǎn),推測(cè)其可能參與催化色氨酸轉(zhuǎn)氨基作用、化學(xué)防御作用、生長(zhǎng)素生物合成等生物學(xué)過(guò)程;SgTAR2基因DNA長(zhǎng)為4103bp,含有4個(gè)內(nèi)含子和5個(gè)外顯子,其內(nèi)含子具有多個(gè)高水平轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子和多個(gè)與激素、環(huán)境等脅迫響應(yīng)相關(guān)的作用元件,暗示SgTAR2基因內(nèi)含子協(xié)同調(diào)控羅漢果生長(zhǎng)素合成、抗脅迫反應(yīng)、形態(tài)發(fā)育等生物學(xué)過(guò)程。實(shí)時(shí)熒光定量結(jié)果顯示,SgTAR2基因在羅漢果各組織器官均有表達(dá),在雌蕊和15d幼果期表達(dá)量較高,暗示該基因參與羅漢果果實(shí)早期發(fā)育。該研究結(jié)果表明SgTAR2參與了生長(zhǎng)素介導(dǎo)的羅漢果不同生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程,特別對(duì)幼果及花的起始發(fā)育和器官形態(tài)建成等具有重要意義。
[Abstract]:Tryptophan transaminase gene family is a key enzyme gene directly involved in the biosynthesis of plant auxin. In this study, the full-length cDNA and DNA sequences of the tryptophan aminotransferase gene (SgTAR2) of Luohanguo were cloned based on the transcriptome sequencing of Luohanguo, and their bioinformatics and spatio-temporal expression were analyzed. The results showed that the full-length cDNA sequence of the cloned SgTAR2 was 2078 BP, the longest ORF was 1332 BP, and the 443 amino acid, Gen Bank accession number was KU949381,. The encoded protein had two alliinase conserved domains and multiple 5'-PLP binding sites. It may be involved in the biological processes of catalytic tryptophan transamino action chemical defense and auxin biosynthesis. The DNA length of SgTAR2 gene is 4103 BP, which contains 4 introns and 5 exons. The intron has many high level transcription regulators and many related elements related to stress response, such as hormone, environment, etc. It is suggested that the intron of SgTAR2 gene co-regulates the biosynthesis of auxin, anti-stress response, morphological development and other biological processes. The results of real-time fluorescence quantitative analysis showed that SgTAR2 gene was expressed in all tissues and organs of Siraitia grosvenori, and was higher in pistil and 15d young fruit, suggesting that SgTAR2 gene was involved in the early development of Siraitia grosvenorii fruit. The results showed that SgTAR2 was involved in the auxin mediated growth and development of Siraitia grosvenori, especially in the initiation and development of young fruits and flowers and organ morphogenesis.
【作者單位】: 廣西大學(xué)農(nóng)學(xué)院;九江市第三人民醫(yī)院;廣西藥用植物園廣西藥用資源保護(hù)與遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31260359) 廣西大學(xué)博士啟動(dòng)項(xiàng)目(XBZ110586)~~
【分類(lèi)號(hào)】:Q943.2;S668.9

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2359714

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