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番鴨細小病毒YL08分離株NS1基因的克隆及序列分析

發(fā)布時間:2018-11-26 15:10
【摘要】:為了了解番鴨細小病毒(MDPV)非結構蛋白(NS1)基因的分子生物學特性,試驗根據GenBank中發(fā)布的其他MDPV基因序列,設計并合成可擴增NS1基因的特異性引物,利用PCR方法從MDPV陽性病料中獲得MDPV YL08株NS1基因,將其克隆至載體p ET-32a(+)中,構建重組質粒p ET-32a-NS1,并進行同源性分析和構建系統(tǒng)發(fā)育進化樹。結果表明:MDPV YL08分離株NS1基因全長為1 884 bp,編碼627個氨基酸;MDPV YL08分離株NS1基因與國內外已發(fā)表的MDPV分離株核苷酸序列同源性為98.5%~99.4%,該分離株與福建株親緣關系最近。
[Abstract]:In order to understand the molecular biological characteristics of (MDPV) nonstructural protein (NS1) gene of muscovy duck parvovirus, specific primers for amplification of NS1 gene were designed and synthesized according to other MDPV gene sequences published in GenBank. The NS1 gene of MDPV YL08 strain was obtained from MDPV positive venereal disease material by PCR method and cloned into vector p ET-32a (). The recombinant plasmid p ET-32a-NS1, was constructed and the phylogenetic tree was constructed by homology analysis. The results showed that the total length of NS1 gene of MDPV YL08 isolate was 1 884 bp, encoding 627 amino acids. The nucleotide sequence homology of NS1 gene between MDPV YL08 isolate and MDPV isolate published at home and abroad was 98.55.99. 4, and this isolate had the closest relationship with Fujian strain.
【作者單位】: 齊齊哈爾大學生命科學與農林學院;齊齊哈爾大學計算機與控制工程學院;黑龍江省獸醫(yī)科學研究所;
【基金】:黑龍江省自然科學基金項目(QC2014C034) 黑龍江省普通本科高等學校青年創(chuàng)新人才培養(yǎng)計劃項目(UNPYSCT-2015093) 齊齊哈爾大學青年教師科研啟動項目(2014k-M06;2014k-Z02)
【分類號】:S852.65

【參考文獻】

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【共引文獻】

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本文編號:2358901

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