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貓皰疹病毒Ⅰ型US3基因剪接異構(gòu)體的鑒定

發(fā)布時(shí)間:2018-11-24 20:52
【摘要】:為鑒定貓皰疹病毒Ⅰ型(FHV-1)US3基因的編碼產(chǎn)物,本研究以提取FHV-1感染細(xì)胞的總RNA為模板,通過RT-PCR方法擴(kuò)增US3基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,測序結(jié)果顯示除了全長US3基因(1 056 bp)外,還出現(xiàn)了一個(gè)825 bp的片段(US3-X1)。該片段是由全長US3基因在226 bp~458 bp位置發(fā)生了自我剪接,導(dǎo)致234 bp DNA缺失而產(chǎn)生,但ORF并沒有改變。此外,通過重疊延伸PCR將US3基因226 bp處堿基"A"突變?yōu)?G"(m US3),改變自我剪接位點(diǎn)。將全長US3基因、m US3和US3-X1基因分別克隆至p3×Flag-CMV-10中,轉(zhuǎn)染F81細(xì)胞,經(jīng)western blot檢測表明FHV-1 US3可以表達(dá)兩種不同分子量的異構(gòu)蛋白,大小約為45 ku和50 ku。這種US3基因的剪接異構(gòu)體現(xiàn)象在豬偽狂犬病毒和人單純皰疹病毒中已有報(bào)道,而FHV-1 US3基因的剪接異構(gòu)體的鑒定尚屬首次。該研究結(jié)果為進(jìn)一步研究FHV-1 US3異構(gòu)體蛋白的功能奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to identify the encoding product of US3 gene of cat herpesvirus type I (FHV-1), the total RNA of FHV-1 infected cells was used as template, and the transcription product of US3 gene was amplified by RT-PCR. In addition to the full-length US3 gene (1 056 bp), a 825 bp fragment (US3-X1) was found. The fragment was generated by self-splicing of the full-length US3 gene at 226 bp~458 bp, resulting in the deletion of 234 bp DNA, but the ORF did not change. In addition, the nucleotide "A" at 226 bp of US3 gene was mutated to "G" (m US3) by overlapping extension of PCR, and the self-splicing site was changed. The full-length US3 gene, m US3 gene and US3-X1 gene were cloned into p3 脳 Flag-CMV-10 and transfected into F81 cell line respectively. Western blot analysis showed that FHV-1 US3 could express two kinds of isomerism proteins with different molecular weight, about 45 ku and 50 ku.. The splicing isomer of US3 gene has been reported in porcine pseudorabies virus and human herpes simplex virus, but the identification of splicing isomer of FHV-1 US3 gene is the first time. The results laid a foundation for further study on the function of FHV-1 US3 isomer proteins.
【作者單位】: 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院;中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所/獸醫(yī)生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國家自然基金青年基金(31402201)
【分類號】:S852.65

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本文編號:2355008

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