【摘要】：AAAP蛋白廣泛存在于各種生物中,在生物生長與發(fā)育過程中扮演重要作用。本研究基于生物信息學(xué)方法對水稻和擬南芥AAAP進(jìn)行系統(tǒng)剖析,旨在深入認(rèn)識該家族基因的序列、表達(dá)及進(jìn)化特征。結(jié)果顯示:擬南芥包括49個AAAP基因,水稻包括71個AAAP基因,這些基因被分為3個類群,細(xì)分為13個亞類群;不同類群基因結(jié)構(gòu)和保守基序均顯示較高的多樣性,亞類群水平基因結(jié)構(gòu)和保守基序顯示出較高的保守性,這說明該家族基因具有多樣化的功能;進(jìn)化樹末端的同源基因?qū)χg表達(dá)情況分化程度較高,但其進(jìn)化速率具有較高的同質(zhì)性,這說明同源基因?qū)Φ姆只饕w現(xiàn)在表達(dá)變化上。這些結(jié)果有助于研究其它植物AAAP家族基因的功能。
[Abstract]:AAAP protein exists widely in various organisms and plays an important role in biological growth and development. Based on bioinformatics, the AAAP of rice and Arabidopsis thaliana were systematically analyzed in order to understand the sequence, expression and evolution of the genes in this family. The results showed that Arabidopsis contained 49 AAAP genes and rice contained 71 AAAP genes. These genes were divided into 3 groups and subdivided into 13 subgroups. The gene structure and conserved motif of different groups showed high diversity, while the subgroup horizontal gene structure and conserved motif showed high conservation, which indicated that the family gene had a variety of functions. The expression of homologous gene pairs at the end of the evolutionary tree was highly differentiated, but its evolution rate was high homogeneity, which indicated that the differentiation of homologous gene pairs was mainly reflected in the change of expression. These results are helpful to study the function of AAAP family genes in other plants.
【作者單位】： 周口師范學(xué)院生命科學(xué)與農(nóng)學(xué)學(xué)院;周口師范學(xué)院河南省作物分子育種與生物反應(yīng)器重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：河南省教育廳項(xiàng)目(17B180009) 周口師范學(xué)院2015年度校本項(xiàng)目(ZKNUB215103)共同資助
【分類號】：Q943.2

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