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辣椒下胚軸不定根發(fā)生相關(guān)差異表達(dá)基因分析

發(fā)布時(shí)間:2018-11-14 14:57
【摘要】:為了探析辣椒(Capsicum annuum)下胚軸不定根發(fā)生的分子機(jī)制,采用轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法研究了不定根發(fā)生誘導(dǎo)期和啟動(dòng)期的差異表達(dá)基因。結(jié)果表明:在AR24/AR0、AR120/AR0和AR120/AR24比較組中分別鑒定到4 991、6 658和4 128個(gè)差異表達(dá)基因,其中1 321個(gè)為3個(gè)比較組所共有。對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO和KEGG顯著性富集分析,發(fā)現(xiàn)辣椒下胚軸不定根發(fā)生的誘導(dǎo)期主要涉及激素應(yīng)答、激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞壁降解與重塑,啟動(dòng)期則是DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄與翻譯、細(xì)胞分裂和細(xì)胞壁合成等;縱觀兩個(gè)時(shí)期,不定根的發(fā)生由生長(zhǎng)素、細(xì)胞分裂素、乙烯和油菜素內(nèi)酯相關(guān)基因調(diào)控,并且與GRAS、AP2、ERF、LBD、SRS、WRKY家族轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)密切相關(guān)。由上可知,辣椒下胚軸不定根發(fā)生是由一系列信號(hào)分子參與且極其復(fù)雜的器官發(fā)生過程。
[Abstract]:In order to explore the molecular mechanism of adventitious root formation in (Capsicum annuum) Hypocotyl of capsicum, the differentially expressed genes in the induction and initiation of adventitious root formation were studied by transcriptome method. The results showed that the differentially expressed genes were identified in the AR24/AR0,AR120/AR0 and AR120/AR24 comparison groups, respectively. GO and KEGG analysis showed that the induction of adventitious roots in the Hypocotyl of capsicum mainly involved in hormone response, hormone signal transduction, cell wall degradation and remodeling, and DNA replication, transcription and translation during initiation. Cell division and cell wall synthesis; Throughout the two periods, adventitious root formation was regulated by auxin, cytokinin, ethylene and Brassinolactone related genes, and was closely related to the expression of GRAS,AP2,ERF,LBD,SRS,WRKY family transcription factors. It can be concluded that adventitious root formation in the Hypocotyl of capsicum is an extremely complex organogenesis process involving a series of signaling molecules.
【作者單位】: 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所農(nóng)業(yè)部園藝作物生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31172001) 國(guó)家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)資金(CARS-25) 公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201303014) 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程項(xiàng)目(CAASASTIP-IVFCAAS)~~
【分類號(hào)】:S641.3

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本文編號(hào):2331499

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