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辣椒下胚軸不定根發(fā)生相關(guān)差異表達基因分析

發(fā)布時間:2018-11-14 14:57
【摘要】:為了探析辣椒(Capsicum annuum)下胚軸不定根發(fā)生的分子機制,采用轉(zhuǎn)錄組學方法研究了不定根發(fā)生誘導期和啟動期的差異表達基因。結(jié)果表明:在AR24/AR0、AR120/AR0和AR120/AR24比較組中分別鑒定到4 991、6 658和4 128個差異表達基因,其中1 321個為3個比較組所共有。對差異表達基因進行GO和KEGG顯著性富集分析,發(fā)現(xiàn)辣椒下胚軸不定根發(fā)生的誘導期主要涉及激素應答、激素信號轉(zhuǎn)導、細胞壁降解與重塑,啟動期則是DNA復制、轉(zhuǎn)錄與翻譯、細胞分裂和細胞壁合成等;縱觀兩個時期,不定根的發(fā)生由生長素、細胞分裂素、乙烯和油菜素內(nèi)酯相關(guān)基因調(diào)控,并且與GRAS、AP2、ERF、LBD、SRS、WRKY家族轉(zhuǎn)錄因子表達密切相關(guān)。由上可知,辣椒下胚軸不定根發(fā)生是由一系列信號分子參與且極其復雜的器官發(fā)生過程。
[Abstract]:In order to explore the molecular mechanism of adventitious root formation in (Capsicum annuum) Hypocotyl of capsicum, the differentially expressed genes in the induction and initiation of adventitious root formation were studied by transcriptome method. The results showed that the differentially expressed genes were identified in the AR24/AR0,AR120/AR0 and AR120/AR24 comparison groups, respectively. GO and KEGG analysis showed that the induction of adventitious roots in the Hypocotyl of capsicum mainly involved in hormone response, hormone signal transduction, cell wall degradation and remodeling, and DNA replication, transcription and translation during initiation. Cell division and cell wall synthesis; Throughout the two periods, adventitious root formation was regulated by auxin, cytokinin, ethylene and Brassinolactone related genes, and was closely related to the expression of GRAS,AP2,ERF,LBD,SRS,WRKY family transcription factors. It can be concluded that adventitious root formation in the Hypocotyl of capsicum is an extremely complex organogenesis process involving a series of signaling molecules.
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)科學院蔬菜花卉研究所農(nóng)業(yè)部園藝作物生物學與種質(zhì)創(chuàng)制重點實驗室;
【基金】:國家自然科學基金(31172001) 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項資金(CARS-25) 公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(201303014) 中國農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程項目(CAASASTIP-IVFCAAS)~~
【分類號】:S641.3

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本文編號:2331499

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