【摘要】：為了解水貂Toll樣受體5(TLR5)蛋白的結(jié)構(gòu)特征和遺傳演化關(guān)系,采用RT-PCR方法從水貂肺臟組織總RNA中擴(kuò)增出TLR5基因的片段,經(jīng)拼接獲得全長(zhǎng)編碼區(qū)序列。序列全長(zhǎng)2 577 bp,編碼858個(gè)氨基酸,含172%的亮氨酸,并有一段20個(gè)氨基酸的信號(hào)肽序列。蛋白預(yù)測(cè)結(jié)果表明,該分子具有親水性,由胞外區(qū)(具有LRR結(jié)構(gòu)域)、跨膜區(qū)和胞內(nèi)區(qū)(具有TIR結(jié)構(gòu)域)組成,表現(xiàn)出典型的TLR家族結(jié)構(gòu)特征;同源性分析結(jié)果顯示,與蒙眼貂同源性最高,達(dá)97%以上,與海象、大熊貓和北極熊同源性80%以上,與其他物種同源性大都在70%以上。水貂TLR5基因序列的成功克隆為進(jìn)一步研究其在水貂機(jī)體免疫應(yīng)答中的作用奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to understand the structural characteristics and genetic evolution of mink Toll like receptor 5 (TLR5) protein, the fragment of TLR5 gene was amplified from total RNA of mink lung tissue by RT-PCR method, and the full-length coding region was obtained by splicing. The complete sequence of 2 577 bp, encodes 858 amino acids, containing 172% leucine and a signal peptide sequence of 20 amino acids. The predicted results showed that the molecule was hydrophilic and consisted of extracellular domain (with LRR domain), transmembrane region and intracellular region (with TIR domain), which showed typical TLR family structure. The results of homology analysis showed that the highest homology with mink was over 97%, the homology with walrus, giant panda and polar bear was over 80%, and the homology with other species was more than 70%. The successful cloning of mink TLR5 gene lays a foundation for further study of its role in mink immune response.
【作者單位】： 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】：科技部科技基礎(chǔ)性工作專項(xiàng)項(xiàng)目(2012FY111000) 山東省優(yōu)秀中青年科學(xué)科研獎(jiǎng)勵(lì)基金(博士基金)(BS2011SW010) 山東省自主創(chuàng)新及成果轉(zhuǎn)化專項(xiàng)(2014ZZCX07105) 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)研究生創(chuàng)新計(jì)劃項(xiàng)目(1215004)
【分類號(hào)】：S865.22

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本文編號(hào)：2310288