【摘要】：Polycomb group(PcG)蛋白是多細胞有機體中的一類表觀遺傳抑制因子,Ring是Pc G蛋白家族的主要成員,在Pc G蛋白的轉(zhuǎn)錄抑制調(diào)控中行使重要功能,對昆蟲和哺乳動物的發(fā)育至關(guān)重要。利用同源檢索方法獲得家蠶Ring基因(BmRing)的核苷酸序列,該基因位于家蠶第17號染色體的nscaf2865位點。BmRing的核苷酸序列由4個外顯子和3個內(nèi)含子構(gòu)成,基因的c DNA3'端有2個多聚腺苷酸化信號(aataaa)和典型的poly(A)結(jié)構(gòu);BmRing編碼由377個氨基酸組成的蛋白質(zhì),分子質(zhì)量為41.8 k D,等電點為6.72,氨基酸序列具有3個同源異型結(jié)構(gòu)域(homeobox domain,HD),46~85 aa為高度保守的典型的環(huán)指結(jié)構(gòu)域(Ring finger),331~347 aa為跨膜區(qū),N端位于膜外。通過STRING在線預測分析得到10個與BmRing有相互作用關(guān)系的蛋白質(zhì)。系統(tǒng)進化分析顯示BmRing與果蠅的Dm SCE、意大利蜜蜂的AmRing等的親緣關(guān)系較近。以家蠶5齡第3天幼蟲的卵巢c DNA為模板,克隆了BmRing基因,并利用半定量RT-PCR檢測BmRing基因在5齡第3天幼蟲的精巢、卵巢、頭部和血細胞中有明顯表達,而在其他組織中幾乎不表達。獲得的上述基礎(chǔ)信息,有益于進一步研究BmRing的生物學功能。
[Abstract]:Polycomb group (PcG) protein is an epigenetic inhibitor in multicellular organisms. Ring is a major member of Pc G protein family. It plays an important role in the regulation of transcription inhibition of Pc G protein and plays an important role in the development of insects and mammals. The nucleotide sequence of Ring gene (BmRing) of Bombyx mori was obtained by homology search method. The nucleotide sequence of BmRing gene was composed of 4 exons and 3 introns, which was located at the nscaf2865 site of chromosome 17 of Bombyx mori. There are two polyadenylate signal (aataaa) and typical poly (A) structure at the c DNA3' end of the gene. BmRing encodes a 377 amino acid protein with a molecular weight of 41.8 KD and a isoelectric point of 6.72. The amino acid sequence has three homologous domains (homeobox domain,HD). 46 ~ 85 aa is a typical conserved ring finger domain, (Ring finger), 331n 347 aa is a transmembrane region, and the N terminal is located outside the membrane. Ten proteins with interaction with BmRing were obtained by STRING online prediction analysis. Phylogenetic analysis showed that BmRing was closely related to Dm SCE, of Drosophila melanogaster Dm SCE, AmRing et al. The BmRing gene was cloned from the ovary c DNA of the 3rd day larva of the 5th instar of Bombyx mori. The expression of BmRing gene was detected by semi-quantitative RT-PCR in the spermary, ovary, head and blood cells of the 3rd day larva of the 5th instar. In other tissues there is little expression. The above basic information is helpful to further study the biological function of BmRing.
【作者單位】： 江蘇科技大學生物技術(shù)學院;家蠶基因組生物學國家重點實驗室西南大學;
【基金】：國家自然科學基金項目(No.31302035) 江蘇省高校自然科學基金項目(No.13KJD230001) 江蘇省自然科學基金項目(No.BK2012273) 江蘇科技大學引進人才科研啟動基金項目(No.35181005,35181003)
【分類號】：S881.2;Q78

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4 徐s，

本文編號：2303488