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綿羊LDHβ基因的生物信息學分析及其在不同剩余采食量綿羊肝臟和肌肉組織中的表達

發(fā)布時間:2018-10-30 07:37
【摘要】:【目的】為鑒定綿羊乳酸脫氫酶β(lactate dehydrogenase B,LDHβ)基因的分子特征,研究其在不同剩余采食量綿羊肝臟和肌肉組織中的表達差異.【方法】測定了137只‘湖羊’公羔的剩余采食量(residual feed intake,RFI),按RFI進行排序,分別篩選出RFI最高(high-residual feed intake,H-RFI)和RFI最低(low-residual feed intake,L-RFI)的羊各15只,屠宰后,采集肝臟和肌肉組織,利用Q-PCR技術(shù)檢測綿羊LDHβ基因分別在H-RFI和L-RFI羊肝臟和肌肉中表達量,并利用生物信息學軟件構(gòu)建了該基因的系統(tǒng)進化樹和預測其結(jié)構(gòu)與功能.【結(jié)果】綿羊LDHβ基因開放閱讀框(open reading frame,ORF)為1 005bp,編碼334個氨基酸,其蛋白質(zhì)分子質(zhì)量為36 479.43U,理論等電點為6.40.綿羊LDHβ基因與山羊的親緣關(guān)系較近,其次為牛,序列同源性高.功能結(jié)構(gòu)域預測結(jié)果顯示,該基因編碼產(chǎn)物在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中參與輔酶因子生物合成的可能性最高.Q-PCR結(jié)果顯示,綿羊LDHβ-mRNA基因在L-RFI羊肝臟和肌肉中表達量均顯著低于H-RFI羊(P0.01).【結(jié)論】綿羊LDHβ基因作為能量代謝的關(guān)鍵酶參與綿羊飼料效率的調(diào)控.
[Abstract]:[objective] to identify the molecular characteristics of lactate dehydrogenase (lactate dehydrogenase) 尾 (lactate dehydrogenase 尾 gene in sheep. To study the difference of its expression in liver and muscle tissues of sheep with different residual feed intake. [methods] the residual feed intake (residual feed intake,RFI) of 137 male lambs of Hu sheep was determined and sorted by RFI. Fifteen sheep with the highest RFI (high-residual feed intake,H-RFI) and the lowest RFI (low-residual feed intake,L-RFI) were selected respectively. After slaughtering, liver and muscle tissues were collected. Q-PCR technique was used to detect the expression of LDH 尾 gene in liver and muscle of H-RFI and L-RFI sheep, respectively. The phylogenetic tree of the gene was constructed by bioinformatics software, and its structure and function were predicted. [results] the open reading frame of sheep LDH 尾 gene (open reading frame,ORF) was 1 005 BP, encoding 334 amino acids. The molecular weight of the protein is 36,479.43 U and the theoretical isoelectric point is 6.40. Sheep LDH 尾 gene was closely related to goats, followed by cattle, with high sequence homology. The predicted results of functional domain showed that the gene encoding product was most likely to participate in coenzyme factor biosynthesis in the endoplasmic reticulum. Q-PCR results showed that the gene encoding product was more likely to participate in coenzyme factor biosynthesis. The expression of LDH 尾-mRNA gene in liver and muscle of L-RFI sheep was significantly lower than that in H-RFI sheep (P0.01). [conclusion] Sheep LDH 尾 gene is involved in the regulation of feed efficiency as a key enzyme of energy metabolism.
【作者單位】: 甘肅農(nóng)業(yè)大學動物科學技術(shù)學院;甘肅省肉羊繁育生物技術(shù)工程實驗室;
【基金】:國家自然科學基金項目(31560625) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(CARS-39)
【分類號】:S826

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本文編號:2299363

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