【摘要】：microRNA(miRNA)在植物生長發(fā)育和環(huán)境脅迫中發(fā)揮著重要的作用.本研究基于49個水稻小RNA測序數(shù)據(jù),系統(tǒng)分析了已知miRNA的表達,并鑒定到了新的水稻miRNA.研究發(fā)現(xiàn),miRBase上注釋的水稻miRNA中,只有39%具有可檢測的表達.此外,對水稻降解組數(shù)據(jù)的分析鑒定到一些新的miRNA靶基因,包括2個新的miR444靶基因,它們分別編碼WD40蛋白和熱休克因子型DNA結(jié)合蛋白.
[Abstract]:MicroRNA (miRNA) plays an important role in plant growth and environmental stress. In this study, based on 49 rice small RNA sequencing data, the expression of known miRNA was analyzed systematically, and a new rice miRNA. was identified. Only 39% of rice miRNA annotated on miRBase had detectable expression. In addition, some new miRNA target genes, including two new miR444 target genes, encoding WD40 protein and heat shock factor type DNA binding protein, were identified by analyzing the degradation data of rice.
【作者單位】： 深圳大學生命與海洋科學學院廣東省植物表觀遺傳學重點實驗室;中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所;
【基金】：國家自然科學基金項目(31571332,31210103901,91440105)
【分類號】：Q943.2

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