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利用高密度SNP遺傳圖譜定位小麥穗部性狀基因

發(fā)布時間:2018-10-22 08:07
【摘要】:小麥穗部性狀之間相關(guān)性密切,其中穗粒數(shù)和千粒重是重要的產(chǎn)量構(gòu)成要素,挖掘與穗部性狀相關(guān)聯(lián)的基因位點對分子標記輔助育種及解釋基因效應具有重要意義。本研究以RIL群體(山農(nóng)01-35×藁城9411)173個F_(8:9)株系為材料,利用90 k小麥SNP基因芯片、DAr T芯片技術(shù)及傳統(tǒng)的分子標記技術(shù)構(gòu)建的高密度遺傳圖譜,在5個環(huán)境下進行穗部相關(guān)性狀QTL定位。檢測到位于1B、4B、5B、6A染色體上7個控制千粒重的加性QTL,解釋表型變異率6.00%~36.30%,加性效應均來自大粒母本山農(nóng)01-35;檢測到8個控制穗長的加性QTL,解釋表型變異率14.34%~25.44%;3個控制穗粒數(shù)的加性QTL;5個控制可育小穗數(shù)的加性QTL;3個控制不育小穗數(shù)的加性QTL,貢獻率為8.70%~37.70%;4個控制總小穗數(shù)的加性QTL;6個控制小穗密度的加性QTL。通過基因型與環(huán)境互作分析,檢測到32個加性QTL,解釋表型變異率0.05%~1.05%。在4B染色體區(qū)段EX_C101685 RAC875_C27536檢測到控制粒重、穗長、穗粒數(shù)、可育小穗數(shù)、不育小穗數(shù)、總小穗數(shù)的一因多效QTL,其貢獻率為5.40%~37.70%,該位點在多個環(huán)境中被檢測到,是穩(wěn)定主效QTL。在6A染色體wPt-0959-TaGw2-CAPS區(qū)間上檢測到控制粒重、總小穗數(shù)的QTL。研究結(jié)果為穗部性狀的分子標記開發(fā)、基因精細定位和功能基因克隆奠定了基礎。
[Abstract]:There is a close correlation among panicle traits, among which the number of grains per ear and 1000-grain weight are important components of yield. It is important to excavate the gene loci associated with panicle traits for molecular marker-assisted breeding and to explain gene effects. In this study, 173 F _ (8:9) lines of RIL population (Shannong 01-35 脳 Gaocheng 9411) were used as materials, the high-density genetic map was constructed by using 90k wheat SNP gene chip, DAr T chip technology and traditional molecular marker technology. QTL mapping of panicle related traits was carried out in 5 environments. An additive QTL, interpretation phenotype variation rate of 6.00 / 36.30g was detected on chromosome 1BX 4BX 5BN 6A to control 1000-grain weight, and the additive effect was all from Shannong 01-35, a large grain parent. Eight additive QTL, interpretations of phenotypic variation rates were detected, which controlled panicle length at 14.34% and 25.44%, respectively, and 3 controlled spikelets were controlled by grain number. The additive QTL, contribution rate of the male sterile spikelets was 8.70% and 37.70% respectively, and the additive QTL; of 4 total spikelets controlled the total spikelet number, and the additive QTL. of the spikelet density controlled 6% of the total spikelet number of male sterile spikelets, and the additive QTL, contribution rate of the sterile spikelet number was 8.70% and 37.70% respectively. By genotypic and environmental interaction analysis, 32 additive QTL, were detected to explain the phenotypic variation rate of 0.05% or 1.05%. In chromosome 4B, EX_C101685 RAC875_C27536 detected the controlled grain weight, panicle length, grain number per spike, fertile spikelet number, sterile spikelet number, total spikelet number and its contribution rate was 5.40% 37.70%. This locus was detected in many environments and was a stable principal QTL.. QTL. with controlled grain weight and total spikelet number was detected in the wPt-0959-TaGw2-CAPS interval of chromosome 6A. The results laid a foundation for molecular marker development, gene fine mapping and functional gene cloning of panicle traits.
【作者單位】: 山東農(nóng)業(yè)大學農(nóng)學院小麥品質(zhì)育種研究室/作物生物學國家重點實驗室;
【基金】:山東省自然科學基金項目(2015ZRB01179,ZR2013CM004) 山東省種質(zhì)資源創(chuàng)制課題資助~~
【分類號】:S512.1

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