【摘要】：黃秋葵為藥食兼用型植物,富含花青素、多糖、黃酮及萜類等活性成分。為探討黃秋葵次級(jí)代謝過程中這些活性物質(zhì)合成的遺傳基礎(chǔ),以紫色黃秋葵嫩莖葉為材料,采用Illumina Hi Seq 2500高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)獲得23 026 500個(gè)短讀序,經(jīng)組裝獲得42 484個(gè)Unigene,平均長(zhǎng)度877 bp。31 931個(gè)和21 926個(gè)Unigene分別在Nr和Swiss Prot數(shù)據(jù)庫(kù)有同源比對(duì)信息;Unigene與COG、KOG數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),根據(jù)其功能各分為24類和25類;通過Pfam數(shù)據(jù)庫(kù),所注釋到的20 031個(gè)Unigene分屬于7 277類蛋白結(jié)構(gòu)域;GO注釋到18 602個(gè)Unigene分為細(xì)胞組分、分子功能及生物學(xué)過程等三大類的51個(gè)功能組,其中大量Unigene與細(xì)胞部分、細(xì)胞、催化活性、結(jié)合活性、代謝進(jìn)程及細(xì)胞進(jìn)程相關(guān);根據(jù)KEGG數(shù)據(jù)庫(kù),可將7 619個(gè)Unigene定位到119個(gè)代謝途徑分支,其中有1、3、35、61、13和70個(gè)Unigene分屬于花色素苷、黃酮、類黃酮、N-多糖、二萜類和萜類骨架生物合成路徑,它們可能參與這些活性物質(zhì)的生物合成。本研究結(jié)果為后續(xù)深入開展黃秋葵花青素、黃酮類等物質(zhì)代謝合成途徑及相關(guān)功能基因研究奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Sunflower is a kind of medicinal and food plant, which is rich in anthocyanins, polysaccharides, flavonoids and terpenoids. In order to study the genetic basis of the synthesis of these active substances in the secondary metabolism of Okra, 23 026 500 short reading sequences were obtained by Illumina Hi Seq 2500 high throughput transcriptome sequencing. The average length of 42,484 Unigene, was 877 bp.31 931 and 21,926 Unigene respectively in Nr and Swiss Prot databases. Unigene was compared with COG,KOG database, which was divided into 24 classes and 25 classes according to their functions. The annotated 20 031 Unigene belong to 7 277 protein domains, and 18 602 Unigene are divided into 51 functional groups of cell components, molecular functions and biological processes, among which a large number of Unigene and cell parts, cells, and catalytic activity. According to the KEGG database, 7 619 Unigene can be located into 119 branches of metabolic pathway, of which there are 1 ~ (3) ~ (3) ~ (35) Unigene and 70 Unigene belong to anthocyanin, flavonoid, N- polysaccharide, respectively. Diterpenoids and terpenoids skeleton biosynthesis pathways that may be involved in the biosynthesis of these active substances. The results laid a foundation for the further study of anthocyanins, flavonoids and related functional genes.
【作者單位】： 福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院亞熱帶農(nóng)業(yè)研究所;福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物研究所;
【基金】：福建省公益類科研院所專項(xiàng)(2016R1012-4) 福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年英才計(jì)劃項(xiàng)目(YC2015-19);福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)PI項(xiàng)目(2016PI-2)
【分類號(hào)】：S649

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