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中華鱉實(shí)時(shí)定量PCR內(nèi)參基因的篩選與評價(jià)

發(fā)布時(shí)間:2018-10-05 14:37
【摘要】:選擇合適的內(nèi)參基因是采用q-PCR方法研究基因表達(dá)的前提.選取中華鱉GAPDH、EF1α、18SrRNA、Tubulin和β-actin等5個(gè)候選內(nèi)參基因,通過q-PCR方法得到各基因在不同組織中的Ct值,利用4種內(nèi)參篩選軟件和綜合評定法進(jìn)行評價(jià).geNorm和NormFinder軟件分析均顯示18SrRNAEF1αβ-actinGAPDHTubulin(穩(wěn)定性由高到低).BestKeeper軟件分析顯示18SrRNAGAPDHEF1αβ-actinTubulin.RefFinder軟件分析和綜合評價(jià)法顯示18SrRNA最佳.推薦優(yōu)先使用18SrRNA或EF1α,不建議用β-actin和Tubulin.上述結(jié)果可為中華鱉和其它爬行動(dòng)物的基因表達(dá)研究提供參考依據(jù).
[Abstract]:The selection of suitable internal reference gene is the premise of using q-PCR method to study gene expression. Five candidate internal reference genes, including tubulin and 尾 -actin, were selected and the Ct values of each gene in different tissues were obtained by q-PCR method in Trionyx sinensis (Trionyx sinensis), including 18s rRNA tubulin and 尾 -actin. The analysis of 18SrRNAEF1 偽 尾 -actinGAPDHTubulin (stability from high to low). BestKeeper software showed that 18SrRNAGAPDHEF1 偽 尾 -actinTubulin.RefFinder software analysis and comprehensive evaluation method showed that 18SrRNA was the best. Preferred use of 18SrRNA or EF1 偽, not 尾 -actin and Tubulin. These results may provide a reference for the gene expression of Trionyx sinensis and other reptiles.
【作者單位】: 河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;保定水產(chǎn)技術(shù)推廣站;
【基金】:河北省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(C2016201207) 河北省現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系淡水養(yǎng)殖創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目
【分類號(hào)】:Q78;S917.4

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本文編號(hào):2253774

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