發(fā)布時間：2018-09-19 14:24

【摘要】：為了研究家蠶cyp450基因家族的密碼子用法及影響密碼子使用模式的主要因子,試驗(yàn)采用多種軟件分析家蠶cyp450基因家族的堿基組成、序列同源性、密碼子偏好性,得到統(tǒng)計(jì)cyp450基因家族密碼子使用偏好性的各項(xiàng)參數(shù),并對各項(xiàng)指數(shù)進(jìn)行相關(guān)性分析。結(jié)果表明:家蠶cyp450基因家族位于AT豐度高的基因組區(qū)域,傾向于使用富含A、T且A、T結(jié)尾的密碼子,整個基因組的同義密碼子使用偏好性較弱;cyp450基因家族的序列同源性很低,大多數(shù)值在40%左右。突變壓力在密碼子的三個位置作用程度相關(guān)性不顯著。說明自然選擇引起的堿基組成變化在家蠶cyp450基因家族密碼子使用中起主要作用。
[Abstract]:In order to study the codon usage of CYP450 gene family in silkworm and the main factors affecting codon usage patterns, several softwares were used to analyze the base composition, sequence homology and codon preference of CYP450 gene family in silkworm. Correlation analysis showed that the CYP450 gene family was located in the genome region with high AT abundance, and tended to use codons rich in A, T and A, T. The synonymous codon preference of the whole genome was weak; the sequence homology of the CYP450 gene family was very low, most of which was about 40%. There was no significant correlation between the degree of placement, indicating that the changes of base composition caused by natural selection played a major role in codon usage of CYP450 gene family in silkworm.
【作者單位】： 承德醫(yī)學(xué)院蠶業(yè)研究所;河北省高校特產(chǎn)蠶桑應(yīng)用技術(shù)研發(fā)中心;承德醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;
【基金】：承德醫(yī)學(xué)院校級課題(201419) 河北省高等學(xué)�？茖W(xué)技術(shù)研究項(xiàng)目(QN2016188) 河北省教育廳重大課題(ZD2016044)
【分類號】：Q78;S881.2

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本文編號：2250390