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胡桃楸成花相關(guān)LFY同源基因的克隆和序列分析

發(fā)布時(shí)間:2018-09-11 08:05
【摘要】:通過(guò)對(duì)胡桃楸成花相關(guān)LFY基因進(jìn)行研究,對(duì)縮短胡桃楸童期,促進(jìn)其提早開花結(jié)實(shí)有著極為重要的意義。采取PCR擴(kuò)增技術(shù),在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行搜索,查找到與目的基因有關(guān)聯(lián)的同源序列;并根據(jù)這些有關(guān)聯(lián)的序列來(lái)進(jìn)行引物設(shè)計(jì),擴(kuò)增目的基因全長(zhǎng)。克隆LFY基因cDNA序列全長(zhǎng)為1 297 bp,其中CDS序列長(zhǎng)1 158 bp,編碼385個(gè)氨基酸。NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)Blast比對(duì)表明胡桃楸LFY同源基因與其他物種的LFY同源基因同源性均在80%以上。將胡桃楸LFY同源基因命名為JmLFY(GenBank登錄號(hào):KX364241)。通過(guò)BioEdit軟件和ProtParam ExPASy在線軟件分析胡桃楸JmLFY蛋白質(zhì)分子式為C_(1878)H_(2962)N_(566)O_(578)S_(13),分子量為43 134.4 Da;理論等電點(diǎn)pI值為6.78;不穩(wěn)定指數(shù)為39.92,屬于不穩(wěn)定蛋白質(zhì)。該研究為進(jìn)一步探索LFY基因?qū)议背苫ǖ挠绊懱峁┮罁?jù)。
[Abstract]:The study of floral related LFY gene of Juglans mandshurica is of great significance in shortening the childhood stage of Juglans mandshurica and promoting its early flowering and fruiting. The PCR amplification technique was used to search the NCBI database to find the homologous sequences associated with the target gene, and the primers were designed to amplify the full length of the target gene. The length of cDNA sequence of LFY gene was 1 297 bp, and the length of CDS sequence was 1 158 bp, encoding 385 amino acids. Blast alignment of NCBI database showed that LFY homology gene of Juglans mandshurica was more than 80% homology with that of other species. The homologous gene of Juglans mandshurica LFY was named JmLFY (GenBank accession number: KX364241). The molecular formula of JmLFY protein of Juglans mandshurica was C _ (1878) H _ (2962) N _ (566) O _ (578) S _ (13), the molecular weight was 43 134.4 Da;, the pI value of isoelectric point was 6.78, and the instability index was 39.92, which was an unstable protein. This study provides the basis for further exploring the effect of LFY gene on flower formation of Juglans mandshurica.
【作者單位】: 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)院;遼寧省固沙造林研究所;東北林業(yè)大學(xué)林學(xué)院林木遺傳育種國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:遼寧省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(20170540801)資助
【分類號(hào)】:Q943.2;S792.132

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2236109

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