【摘要】：為研究倭竹族Shibataeeae中14-3-3非ε類基因的結(jié)構(gòu)及其編碼區(qū)單核苷酸多態(tài)性,分別從倭竹族5個不同屬的代表種中獲得14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e,14-3-3f的基因全長。這些基因均包含5個外顯子和4個內(nèi)含子,編碼序列(CDS)大小為771~789 bp。14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e和14-3-3f編碼區(qū)序列中分別有21,19,26和17個單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn),SNP頻率分別為1SNP/38 bp,1SNP/41 bp,1SNP/30 bp,1SNP/46 bp,基因核苷酸多樣性(π)值分別為0.012 17,0.011 83,0.015 21,0.010 38。同一基因在不同竹種間氨基酸序列一致性均達(dá)99%以上,毛竹Phyllostachys edulis Pe14-3-3b,Pe14-3-3c,Pe14-3-3e,Pe14-3-3f蛋白的理化性質(zhì)非常相似,均為親水性蛋白,含量較多的是丙氨酸(ala),谷氨酸(glu),亮氨酸(leu),等電點(diǎn)為4.75~4.90,這4個蛋白的二級結(jié)構(gòu)也非常相似,α-螺旋結(jié)構(gòu)含量最高,無規(guī)則卷曲其次,β-轉(zhuǎn)角和延伸鏈很少。上述研究為進(jìn)一步探索竹類植物14-3-3生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to study the structure and coding region single nucleotide polymorphism of 14-3-3 non-蔚 gene in Shibataeeae of Bamboo, the full length of 14-3-3bSE-14-3-3f gene was obtained from 5 representative species of different genera of Bamboo family. These genes contain five exons and four introns. The nucleotide diversity (蟺) of the coding sequence (CDS) was 771 ~ 789 bp.14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e and 14-3-3f, respectively. The frequency of SNPs in the coding region was 21 / 19 / 26 and 17 / 17, respectively. The nucleotide diversity (蟺) of the 1SNP/38 bp,1SNP/41 bp,1SNP/30 bp,1SNP/46 bp, gene was 0.012 / 711 / 830.015 / 21 and 0.010 / 38, respectively. The amino acid sequence of the same gene was more than 99% in different bamboo species. The physicochemical properties of Phyllostachys edulis Pe14-3-3b,Pe14-3-3c,Pe14-3-3e,Pe14-3-3f protein in Phyllostachys pubescens were very similar and they were hydrophilic proteins. The content of alanine (ala), glutamate (glu), leucine (leu), was 4.75 ~ 4.90. The secondary structure of the four proteins was similar, the content of 偽 -helix structure was the highest, the irregular curl was the second, and the 尾 -rotation angle and extension chain were few. The above studies lay a foundation for further exploring the biological functions of 14-3-3 bamboos.
【作者單位】： 浙江農(nóng)林大學(xué)亞熱帶森林培育國家重點(diǎn)實(shí)驗室培育基地;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項目(30901155) 浙江省自然科學(xué)基金資助項目(Y307499)
【分類號】：S795

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號：2233640