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珙桐CAC基因的克隆及其作為內(nèi)參基因的評價

發(fā)布時間:2018-09-08 07:24
【摘要】:從珙桐(Davidia involucrata Baill.)中克隆到一個編碼網(wǎng)格蛋白銜接蛋白復(fù)合物(Clathrin adaptor complexes,CAC)的基因,命名為DiCAC(Gen Bank登錄號為KX268525)。該基因開放閱讀框全長1 317 bp,編碼438個氨基酸。同源序列比對與聚類分析表明,該基因與其它15種植物的CAC氨基酸序列的相似度達(dá)到94%以上,其中與葡萄CAC的氨基酸序列同源性最高。為評價該基因作為珙桐內(nèi)參基因的可行性,結(jié)合5個珙桐管家基因(ACT7、EF1a、GAPDH、β-TUB、18S rRNA),采用半定量PCR和實(shí)時熒光定量PCR對DiCAC基因在珙桐不同組織以及不同發(fā)育階段苞片中的表達(dá)穩(wěn)定性進(jìn)行分析,并與常見管家基因的穩(wěn)定性進(jìn)行比較,結(jié)果表明,該基因在珙桐不同組織以及不同發(fā)育階段苞片中均為穩(wěn)定表達(dá),且表達(dá)穩(wěn)定性優(yōu)于常見管家基因,可以作為相關(guān)基因表達(dá)研究中的內(nèi)參基因。首次克隆到珙桐CAC基因,并且明確了其作為內(nèi)參基因的可行性,為深入研究珙桐相關(guān)基因的表達(dá)分析提供了候選內(nèi)參基因資源。
[Abstract]:(Davidia involucrata Baill.) from Davidia involucrata A gene encoding the conjugate protein complex (Clathrin adaptor complexes,CAC) was cloned and named DiCAC (Gen Bank accession number (KX268525). The open reading frame of this gene encodes 438 amino acids with a total length of 1 317 bp,. The homologous sequence alignment and cluster analysis showed that the similarity of the CAC amino acid sequence between the gene and other 15 plants was over 94%, and the amino acid sequence homology with grape CAC was the highest. In order to evaluate the feasibility of this gene as an internal ginseng gene of Davidia involucrata, The expression and stability of DiCAC gene in bracts of different tissues and different developmental stages of Davidia involucrata were analyzed by semi-quantitative PCR and real-time fluorescence quantitative PCR combined with five housekeeping genes (ACT7,EF1a,GAPDH, 尾 -TUBX 18s rRNA), and the stability of DiCAC gene was compared with that of common housekeeper genes. The results showed that the gene was stably expressed in different tissues and bracts of Davidia involucrata, and its expression stability was superior to that of housekeeping genes. The CAC gene of Davidia involucrata was cloned for the first time, and its feasibility as an internal reference gene was confirmed, which provided candidate internal reference gene resources for further study on the expression and analysis of related genes of Davidia involucrata.
【作者單位】: 中南林業(yè)科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【基金】:中南林業(yè)科技大學(xué)博士后科研基金項(xiàng)目(0490016);中南林業(yè)科技大學(xué)青年基金項(xiàng)目(QJ201512)
【分類號】:S792.99;Q943.2

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