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馴鹿EGFR基因克隆及序列分析

發(fā)布時間:2018-09-07 10:05
【摘要】:以快速生長期雄性馴鹿(Rangifer tarandus)鹿茸頂端表皮組織為研究材料,提取其頂端表皮組織總RNA,參考GenBank數(shù)據(jù)庫中牛、羊的表皮生長因子受體(EGFR)基因序列設計同源引物;采用RT-PCR技術、分子克隆技術首次成功獲得雄性馴鹿茸頂端表皮組織EGFR基因編碼區(qū)部分cDNA序列,片段大小為910 bp;Blast比對發(fā)現(xiàn)馴鹿EGFR基因與牛、羊、馬、人、鯨、野豬的同源性分別是97%、96%、88%、86%、92%、89%,同源性均在85%以上,表明馴鹿EGFR基因在進化上比較保守;構(gòu)建系統(tǒng)進化樹發(fā)現(xiàn)馴鹿EGFR基因與牛親緣關系最近,與人的親緣關系最遠;最后通過在線分析軟件預測獲得EGFR基因序列對應mRNA最小自由能二級結(jié)構(gòu)。
[Abstract]:The epidermal tissue of (Rangifer tarandus) antler apical epidermis of male reindeer in rapid growing stage was used as the research material. The epidermal growth factor receptor (EGFR) gene sequence of cattle and sheep was extracted from the total RNA, reference GenBank database of the apical epidermis tissue of male reindeer. RT-PCR technique was used to design homologous primers. Molecular cloning technique was the first time to obtain the partial cDNA sequence of the EGFR gene coding region of male tame antler apical epidermis tissue. The length of the fragment was 910 bp;Blast and the reindeer EGFR gene was found to be associated with cattle, sheep, horse, human and whale. The homology of wild boar is 979%, the homology is more than 85%, which indicates that the EGFR gene of reindeer is conserved in evolution, and the phylogenetic tree shows that EGFR gene has the closest relationship with cattle, and has the furthest phylogenetic relationship with human. Finally, the minimum free energy secondary structure of mRNA corresponding to EGFR gene sequence was obtained by online analysis software.
【作者單位】: 東北林業(yè)大學;
【基金】:國家林業(yè)局珍稀瀕危物種野外救護與繁育項目(2012) 中央高;究蒲袠I(yè)務專項資金項目(2572016AA42)
【分類號】:Q953

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