【摘要】：克隆決明胰蛋白酶抑制劑2(Cassia obtusifolia trypsin inhibitor 2,COTI2)基因序列,并考察其在不同環(huán)境下的表達(dá)模式。利用RACE方法克隆了COTI2基因的部分序列,利用定量PCR考察其在鹽、低溫、干旱及ABA處理下的表達(dá)模式。從決明種子c DNA中克隆出了長(zhǎng)度為565 bp的基因片段,該片段具有典型的Kunitz蛋白酶抑制劑基因家族的結(jié)構(gòu)域。將得到的序列提交GenBank,序列號(hào)為ku745416。對(duì)獲得的COTI2的氨基酸序列進(jìn)行比較分析,發(fā)現(xiàn)COTI2的P1位殘基為Ser38。COTI2與其它植物KTI的氨基酸序列的進(jìn)化分析表明,其與楊樹的同源性較近。定量PCR結(jié)果表明COTI2在不同環(huán)境下具有不同的表達(dá)模式。這為研究COTI2基因的功能及分子調(diào)控機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:The gene sequence of Cassia trypsin inhibitor 2 (Cassia obtusifolia trypsin inhibitor 2 and COTI2) was cloned and its expression patterns in different environments were investigated. The partial sequence of COTI2 gene was cloned by RACE, and the expression patterns of COTI2 gene under salt, low temperature, drought and ABA treatments were investigated by quantitative PCR. A 565 bp gene fragment was cloned from c DNA of the seed of Cassia sinensis, which has the domain of typical Kunitz protease inhibitor gene family. Submit the resulting sequence to the GenBank, sequence number as ku745416. The amino acid sequence of COTI2 was compared and analyzed. It was found that the P1 residue of COTI2 was the amino acid sequence of Ser38.COTI2 and other plant KTI. The result showed that the amino acid sequence of COTI2 was close to that of poplar. Quantitative PCR results showed that COTI2 had different expression patterns in different environments. This will lay a foundation for studying the function and molecular regulation mechanism of COTI2 gene.
【作者單位】： 西南交通大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31371232,31500276) 成都市科技技術(shù)研發(fā)項(xiàng)目(2015-HM01-00051-SF) 國家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃資助項(xiàng)目(201510613070)
【分類號(hào)】：Q943.2

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本文編號(hào)：2215652