【摘要】：通過分析稻瘟病菌Rho GAP家族基因與幾丁質(zhì)合酶家族基因的表達(dá)關(guān)系,研究該家族基因?qū)?xì)胞壁形成的影響。利用不同生物信息學(xué)軟件對(duì)Rho GAP家族進(jìn)行序列分析,運(yùn)用RT-PCR技術(shù)獲得了該家族基因的部分c DNA序列,通過實(shí)時(shí)熒光定量技術(shù)分析Rho GAP基因與幾丁質(zhì)合酶基因的表達(dá)關(guān)系。結(jié)果表明,稻瘟病菌數(shù)據(jù)庫中8個(gè)Rho GAP基因均含有保守的GAP結(jié)構(gòu)域,且為水溶性蛋白,蛋白分子量相對(duì)較大,系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示,16個(gè)Rho GTP酶激活蛋白可分為兩類;不同的幾丁質(zhì)合成酶基因在不同Rho GAP基因突變體中的表達(dá)量不同,總的趨勢(shì)是上調(diào)的。說明Rho GAP基因家族蛋白可能參與了稻瘟病菌不同階段細(xì)胞壁的合成,本結(jié)果為進(jìn)一步研究Rho GAP家族基因參與多樣性的代謝途徑奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:The effect of Rho GAP family gene on cell wall formation was studied by analyzing the relationship between the gene expression of Rho GAP family and chitinase family gene. The Rho GAP family was sequenced by using different bioinformatics software. The partial c DNA sequence of the family gene was obtained by RT-PCR technique. The relationship between Rho GAP gene and chitinase gene was analyzed by real-time fluorescence quantitative technique. The results showed that 8 Rho GAP genes contained conserved GAP domain in rice blast pathogen database and were water-soluble proteins with relatively large molecular weight. Phylogenetic analysis showed that 16 Rho GTP activator proteins could be classified into two groups. Different chitinase genes were expressed in different Rho GAP gene mutants, and the general trend was up-regulated. The results suggested that Rho GAP gene family proteins might be involved in cell wall synthesis in different stages of rice blast fungus, which laid a foundation for further study on the metabolic pathway of Rho GAP family genes involved in diversity.
【作者單位】： 福建農(nóng)林大學(xué)生命學(xué)院;福建農(nóng)林大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院;中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院椰子研究所;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31500118,31571943)資助
【分類號(hào)】：S435.111.41

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本文編號(hào)：2214960