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基于RNA-seq的套袋對‘天源紅’獼猴桃果實(shí)花色苷合成關(guān)鍵結(jié)構(gòu)基因表達(dá)的影響

發(fā)布時(shí)間:2018-08-24 11:43
【摘要】:【目的】探討套袋對紅肉獼猴桃果實(shí)生長發(fā)育過程中不同部位花色苷合成關(guān)鍵結(jié)構(gòu)基因表達(dá)的影響,為解析光照對花色苷合成分子機(jī)制的影響提供依據(jù)!痉椒ā恳匀t型軟棗獼猴桃‘天源紅’為試材并對其進(jìn)行套袋處理,在RNA-seq的基礎(chǔ)上,篩選候選基因,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR對這些候選基因在‘天源紅’盛花后7個(gè)時(shí)期的果肉樣品中的表達(dá)量進(jìn)行相對定量。根據(jù)熒光定量結(jié)果和聚類分析,最終確定關(guān)鍵候選基因,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR對關(guān)鍵候選基因在‘天源紅’不同處理、不同時(shí)期、不同果實(shí)部位中的表達(dá)量進(jìn)行相對定量分析,并對關(guān)鍵候選基因的表達(dá)量和花色苷含量進(jìn)行相關(guān)性分析。【結(jié)果】12個(gè)候選基因在盛花后7個(gè)時(shí)期中的表達(dá)具有一定的規(guī)律,且各自的表達(dá)規(guī)律不盡相同。在果肉顏色明顯變?yōu)榧t色的盛花后110 d,F3H、LDOX和F3GT的表達(dá)量較其他時(shí)期高。聚類分析結(jié)果顯示,LDOX和F3GT分別聚為一類,且與其他的基因明顯分開。LDOX在處理1和處理2的果肉以及處理3的果心中的表達(dá)量與花色苷含量呈極顯著相關(guān),而F3GT在處理1的果肉和處理3的果心中的表達(dá)量與花色苷含量呈極顯著相關(guān)。【結(jié)論】LDOX和F3GT可能是‘天源紅’果實(shí)花色苷生物合成途徑中的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)基因。套袋抑制LDOX在‘天源紅’外果皮、果肉中的表達(dá),而一直套袋促進(jìn)其在果心中的表達(dá)。套袋抑制了F3GT在果肉中的表達(dá),而對果心中F3GT的表達(dá)無明顯影響。
[Abstract]:[Objective] To investigate the effect of Bagging on the expression of key genes involved in anthocyanin biosynthesis in different parts of red Kiwifruit during its growth and development, and to provide basis for the analysis of the molecular mechanism of anthocyanin biosynthesis under illumination. On this basis, candidate genes were screened, and the expression of these candidate genes in pulp samples at 7 stages after flowering was quantified by real-time fluorescence quantitative PCR. According to the results of fluorescence quantitative analysis and cluster analysis, the key candidate genes were finally identified, and the key candidate genes were identified by real-time fluorescence quantitative PCR. The relative quantitative analysis of the expression of the key candidate genes and the content of anthocyanin were carried out in different fruits of different treatments and different stages. The results of cluster analysis showed that LDOX and F3GT were clustered into one group and were distinctly separated from other genes. The expression of LDOX in the flesh of treatment 1 and treatment 2 and in the heart of treatment 3 was significantly correlated with anthocyanin content, whereas F3GT was present in the flesh of treatment 1 and treatment 2. [Conclusion] LDOX and F3GT may be the key structural genes in anthocyanin biosynthesis pathway of'Tianyuan Red'fruit. Bagging inhibits the expression of LDOX in the exocarp and pulp of'Tianyuan Red', and bagging promotes the expression of LDOX in the core of'Tianyuan Red'. Bagging inhibited the expression of F3GT in pulp, but had no significant effect on the expression of F3GT in fruit.
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所·中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院果樹生長發(fā)育與品質(zhì)控制重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31401825) 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程專項(xiàng)(CAAS-ASTIP-2016-ZFRI) 河南省大宗水果產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(S2014-11)
【分類號】:S663.4

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本文編號:2200722

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