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環(huán)丙沙星對小鼠原代肝細胞基因表達譜芯片的研究

發(fā)布時間:2018-07-31 17:00
【摘要】:目的研究環(huán)丙沙星對小鼠原代肝細胞基因表達的影響。方法實驗組(EG)和對照組(CG)小鼠分別灌胃給予環(huán)丙沙星和生理鹽水7d提取肝細胞,采用Agilent基因表達譜芯片技術(shù)檢測基因表達,對差異表達基因進行生物信息學分析,并挑選部分基因進行熒光定量PCR驗證。結(jié)果 (1)實驗組小鼠肝細胞中共篩選到328個差異表達基因(fold-change1.5或0.667)。(2)基因本體論(gene ontology,GO)功能分析顯示差異表達基因主要富集在細胞有絲分裂周期、轉(zhuǎn)移酶活性調(diào)節(jié)、催化活性調(diào)節(jié)和細胞周期調(diào)控等生物學過程;KEGG pathway分析則顯示內(nèi)吞、P53和HIF-1信號通路受到影響。(3)環(huán)丙沙星上調(diào)SCARA5和OSGIN1基因,下調(diào)PFKFB3和SMOC2基因,4個基因表達的熒光定量PCR與芯片測試結(jié)果相符。結(jié)論環(huán)丙沙星影響腫瘤發(fā)生發(fā)展的生物學過程,并可能通過調(diào)控SCARA5、OSGIN1、PFKFB3和SMOC2等腫瘤相關(guān)基因發(fā)揮抗腫瘤活性。
[Abstract]:Objective to study the effect of ciprofloxacin on gene expression in mouse primary hepatocytes. Methods (EG) mice in experimental group and (CG) mice in control group were given ciprofloxacin and normal saline respectively for 7 days to extract liver cells. Agilent gene expression microarray technique was used to detect gene expression, and bioinformatics analysis of differentially expressed genes was carried out. Some genes were selected for fluorescence quantitative PCR verification. Results (1) A total of 328,328differentially expressed genes (fold-change1.5 or 0.667). (2) were screened out from the hepatocytes of the experimental group. The functional analysis of gene ontology go showed that the differentially expressed genes were mainly enriched in the mitotic cycle, and the activity of transferase was regulated. KEGG pathway analysis showed that endocytosis p53 and HIF-1 signaling pathway were affected. (3) ciprofloxacin upregulated SCARA5 and OSGIN1 genes. PFKFB3 and SMOC2 genes were down-regulated. The fluorescence quantitative PCR of four genes were in agreement with the results of microarray test. Conclusion ciprofloxacin affects the biological process of tumor development and may play an antitumor role by regulating SCARA5 OSGIN1 PFKFB3 and SMOC2 genes.
【作者單位】: 四川抗菌素工業(yè)研究所成都大學;
【分類號】:R965

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本文編號:2156243

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