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基于毛木耳CDS的福壽螺多功能纖維素酶基因密碼子優(yōu)化分析

發(fā)布時(shí)間:2018-07-21 19:17
【摘要】:【目的】克隆福壽螺多功能纖維素酶基因(multi-functional cellulase gene,Mfc),進(jìn)行密碼子優(yōu)化改造,便于后續(xù)毛木耳Mfc基因轉(zhuǎn)導(dǎo)研究!痉椒ā坎捎肅odon W軟件分析福壽螺多功能纖維素酶基因Mfc及毛木耳轉(zhuǎn)錄本CDS密碼子使用次數(shù)和同義密碼子相對(duì)使用度差異,以毛木耳CDS密碼子特征對(duì)福壽螺Mfc基因進(jìn)行密碼子優(yōu)化。【結(jié)果】改造后的Mfcsg序列GC含量從原始Mfc序列的54.04%增加到58.16%,與毛木耳遺傳背景一致!窘Y(jié)論】實(shí)驗(yàn)優(yōu)化后獲得的Mfcsg基因序列GC含量與毛木耳遺傳背景一致,沒(méi)有發(fā)夾結(jié)構(gòu)、重復(fù)序列及反向重復(fù)序列,能夠作為毛木耳外源基因轉(zhuǎn)化應(yīng)用。
[Abstract]:[objective] to clone the multifunctional cellulase gene (multi-functional cellulase gene MFC) from snail, and to optimize the codon modification. [methods] the multifunctional cellulase gene MFC and CDS codon were analyzed by Codon W software. The codon of MFC gene was optimized by CDS codon characteristics of Auricularia tuber. [results] the GC content of the modified Mfcsg sequence increased from 54.04% of the original MFC sequence to 58.16% of the original MFC sequence, which was consistent with the genetic background of Auricularia tuber. [conclusion] Experimental optimization. The GC content of Mfcsg gene sequence was consistent with the genetic background of Auricularia pubescens. No hairpin structure, repeat sequence and reverse repeat sequence can be used as foreign gene transformation of Auricularia pubescens.
【作者單位】: 四川省農(nóng)業(yè)科學(xué)院土壤肥料研究所;四川大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物資源與生態(tài)環(huán)境教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:四川省財(cái)政創(chuàng)新能力提升工程項(xiàng)目(2014QNJJ-012) 突破性食用菌新品種選育、育種材料與方法創(chuàng)新項(xiàng)目“毛木耳抗病新品種選育研究” 國(guó)家食用菌產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-24) 四川食用菌創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)
【分類(lèi)號(hào)】:S646.6

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本文編號(hào):2136574


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