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重瓣百合LiSEP3基因克隆與表達分析

發(fā)布時間:2018-07-21 14:28
【摘要】:【目的】克隆百合LiSEP3基因并確定其在百合不同地上器官及不同花瓣中的表達差異,探討SEP3基因在重瓣花中的表達模式!痉椒ā坷肦ACE方法從重瓣百合品種‘比羅尼卡’中克隆得到LiSEP3基因核苷酸序列,利用SMART軟件對其蛋白結(jié)構(gòu)進行分析,以MEGA 5.0軟件進行系統(tǒng)進化樹分析,用基因槍轟擊法進行亞細胞定位分析,采用熒光定量PCR進行不同地上器官及不同花瓣中LiSEP3基因表達差異分析。【結(jié)果】LiSEP3基因?qū)儆贛ADS-box家族E類基因,其開放閱讀框為729 bp,共編碼242個氨基酸;LiSEP3基因編碼的蛋白具有典型的MADS結(jié)構(gòu)域、K-box區(qū)及2個SEP基序;LiSEP3與同為單子葉植物的六出花的SEP3親緣關(guān)系最近;LiSEP3蛋白定位于細胞核中;LiSEP3基因在花中的相對表達量最高,在莖、葉中幾無表達;在1~7輪花瓣中均能檢測到LiSEP3表達,且位于最內(nèi)側(cè)的第7輪花瓣中相對表達量最高。【結(jié)論】LiSEP3基因?qū)儆贛ADS-box家族E類基因,主要在花中表達,其中在最內(nèi)側(cè)花瓣中表達量最高,其表達模式與雙子葉植物花中SEP3基因表達模式存在不同。
[Abstract]:[objective] to clone the LiSEP3 gene and determine the difference of its expression in different shoot organs and petals of lily. To investigate the expression pattern of SEP3 gene in double flower. [methods] the nucleotide sequence of LiSEP3 gene was cloned from double lily variety 'Bironica' by race method, and its protein structure was analyzed by smart software. The phylogenetic tree analysis was carried out by MEGA5.0 software, and subcellular localization was analyzed by gene gun bombardment. Fluorescence quantitative PCR was used to analyze the difference of LiSEP3 gene expression in different aboveground organs and petals. [results] LiSEP3 gene belongs to MADS-box family E gene. Its open reading frame is 729bp.The protein encoding 242 amino acids LiSEP3 gene has a typical MADS domain, K-box region and two SEP motifs, LiSEP3 is closely related to SEP3 of six flowers in monocotyledonous plants. The relative expression of LiSEP3 gene was the highest in the flower. LiSEP3 was not expressed in stem and leaf, LiSEP3 could be detected in 1 and 7 petal, and the relative expression of LiSEP3 was highest in the innermost seventh petal. [conclusion] LiSEP3 gene belongs to MADS-box family E gene and is mainly expressed in flower. The expression pattern of SEP3 gene was different from that in dicotyledonous flowers.
【作者單位】: 阜陽師范學(xué)院生物與食品工程學(xué)院;中國農(nóng)業(yè)大學(xué)觀賞園藝與園林系花卉發(fā)育與品質(zhì)調(diào)控北京市重點實驗室;聊城大學(xué)農(nóng)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(31471904) 安徽省教育廳自然科學(xué)研究重點項目(KJ2016A871) 安徽省高校質(zhì)量工程項目(2015jyxm221)
【分類號】:S682.29

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