【摘要】：本研究克隆綿羊卵巢微精蛋白β(PSP94)基因,旨在預(yù)測其編碼蛋白的結(jié)構(gòu)與功能。以河北小尾寒羊作為試驗動物,提取卵巢組織RNA,采用RT-PCR和pMD19-T載體,克隆測序得到PSP94基因序列,結(jié)合生物信息學(xué)方法分析其生物學(xué)特性。結(jié)果表明,綿羊發(fā)情期和間情期卵巢中均有PSP94基因表達(dá),克隆得到的綿羊PSP94長度為462 bp,開放閱讀框(ORF)長度為336 bp,編碼111個氨基酸,系統(tǒng)聚類分析圖分析表明綿羊與牛遺傳距離較近;生物信息學(xué)預(yù)測顯示,該蛋白屬于穩(wěn)定酸性親水蛋白,有5個磷酸化位點和2個N-糖基化位點,亞細(xì)胞定位于胞外,屬于分泌蛋白,N端有信號肽,沒有跨膜結(jié)構(gòu)域。蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)主要結(jié)構(gòu)元件是α-螺旋、延伸鏈和不規(guī)則卷曲。
[Abstract]:This study cloned the ovine ovarian sperm protein beta (PSP94) gene to predict the structure and function of its encoded protein. Taking Hebei Small Tail Han sheep as an experimental animal, extracting RNA of ovarian tissue, using RT-PCR and pMD19-T vectors, cloning and sequencing the sequence of PSP94 gene and analyzing its biological characteristics with bioinformatics methods. The results showed that sheep PSP94 gene expression was found in the oestrus and estrous ovary. The length of sheep PSP94 was 462 BP, the length of the open reading frame (ORF) was 336 BP, and 111 amino acids were encoded. The genetic distance between sheep and cattle was closer to the sheep and cattle. The bioinformatics prediction showed that the protein belonged to the stable acid hydrophilic protein and 5 phosphoric acid. The loci and 2 N- glycosylation sites are located outside the cell, belonging to the secretory protein, the N terminal has a signal peptide and no transmembrane domain. The main structural elements of the protein two structure are alpha helix, extended chain and irregular curl.
【作者單位】： 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院;河北科技師范學(xué)院動物科技學(xué)院;
【基金】：河北省高等學(xué)�？茖W(xué)技術(shù)研究青年基金項目(QN2015162) 河北省首批青年拔尖人才支持計劃(2016-2018)
【分類號】：S826

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本文編號：2119876